房山区m1ARNA甲基化测序

1. m1A-MAP技术及其在tRNA中的验证,利用m1A会导致错配的特性，采用去甲基化酶AlkB来实现m1A去甲基化，对比(-)去甲基化酶和(+)去甲基化酶的结果，捕捉碱基突变的信号，来实现m1ARNA修饰位点单碱基分辨率的鉴定，为了增加检测灵敏度，作者还利用抗体富集的方式来特异性富集m1A的RNA的片段，作者将这个方法命名为m1A-MAP。在哺乳动物中，已知tRNA第9，14和58位会发生m1ARNA修饰，通过这个技术，细胞质中tRNAAsp(GUC)第9位及tRNA第58位都被检测到m1ARNA修饰，以上结果都证实该方法确实可有效单碱基分辨率的鉴定m1ARNA修饰位点。云序从m1A，m5C，到m6A RNA修饰，我们都有着高质量的成果产出。房山区m1ARNA甲基化测序

此研究由云序生物合作客户华南农业大学余义勋课题组完成的，该课题组利用m1A-seq&RNA-seq（本实验云序提供）技术对矮牵牛花瓣中含m1A修饰的RNA进行全转录组分析，发现乙烯处理降低了花瓣mRNAm1A峰的水平。另外还发现矮牵牛tRNA特异性甲基转移酶61A(PhTRMT61A)的沉默降低了体内和体外mRNA的m1A水平，定位于细胞核内的PhTRMT61A被抑制会导致叶片发育异常。这些研究结果显示RNAm1A修饰可以作为表观转录组调控机制并在植物生长发育中起着重要作用。矮牵牛m1A峰的motif序列和结构特征,矮牵牛m1A峰的motif序列和结构特征,云序生物热门RNA修饰—m5C甲基化。衡水m1AlncRNA测序云序技术优势，可单碱基分辨率检测m1A甲基化修饰。

自2010年以来，RNA表观遗传学概念提出后，随后几年这一领域的研究便如火如荼的开展起来，同时也取得了zhuo越的成果，其中包括m6A，m5C RNA甲基化修饰等，而我们要来谈一谈的是近发表在Molecular Cell （IF：14.714）上的一篇关于m1A RNA甲基化的文章，这是一类新型RNA修饰，想必大家也迫不及待地想看看科研研究成果了吧，话不多说，让我们来一探究竟。云序生物是一家比较不错的做RNA甲基化的公司，他们的RNA甲基化口碑很好，m1A RNA甲基化是一类新发现的RNA甲基化，即RNA分子腺嘌呤di1位氮原子上的甲基化修饰（N1-methyladenosine，m1A）。

2.m1A-MAP揭示人全转录组m1A修饰,作者通过m1A-MAP在人全转录组水平上进行检测，发现了740个m1A修饰位点，其中473个位点位于mRNA和lncRNA，大部分位于5’-UTR。通过比对SNP数据库，作者还排除了假阳性结果。另外，作者通过多核糖体图谱还发现5’-UTR区域发生m1A与mRNA翻译效率呈正相关，且这种正相关性在cap+1位置上更xian著，但在CDS区域和3’-UTR区都没有出现。这些发现不同位置的m1A修饰可能发挥不同的生物学功能。通过motif分析，作者发现m1A修饰位点偏好GUUCRA序列。另外，作者发现TRMT6/61A不仅是tRNAm1A甲基化酶复合物，也是mRNA上发生m1A修饰所需要的酶。细胞样品或新鲜组织块（切成5-10 mg的小块），可用TRIZOL或RNA保护剂处理。

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Molecular Cell:细胞核和线粒体编码的转录本的m1A甲基化修饰：Base-Resolution。房山区m1ARNA甲基化测序

生物化学表征分析显示：ALKBH1在体外或者细胞内对tRNA中的m1A甲基化都具有去甲基化活性。同时展示了ALKBH1控制tRNAiMet以影响翻译起始，并且m1A甲基化的tRNA优先被招募到多核糖体以促进翻译伸长。ALKBH1介导的tRNA去甲基化控制在翻译中具靶标的效用翻tRNAs,从而直接影响蛋白质的合成。这个过程是动态的，并被人类细胞用于对葡萄糖剥夺作出反应。这一发现打开了一个潜在的可逆tRNA甲基化影响基因表达的新范式。云序生物是一家比较不错的做RNA甲基化的公司，他们的RNA甲基化口碑很好，房山区m1ARNA甲基化测序

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