同位素标记的秸秆还可以制备成生物炭。有学者利用13C稳定同位素标记的小麦秸秆制备生物炭，并研究了生物炭在不同土壤中激发效应的差异。生物炭在寒区水稻土以及黄淮海水稻土中引发了的负激发效应，激发效应量分别为-284mgC/kg土和-157mgC/kg土；而其在红壤性水稻土以及低肥力红壤性水稻土中引发正激发效应，但并不，激发效应量分别为33.3mgC/kg土和58.0mgC/kg土。生物炭激发效应量与土壤的电导率（r=-0.884）及pH（r=-0.824）成极的负相关关系。研究表明，在评估生物炭固碳潜力时，应综合考虑生物炭自身矿化速率和生物炭引发的土壤碳激发效应。哪里可以买到稳定同位素标记秸秆？福建小麦同位素标记秸秆
在研究土壤碳周转现状时，13C稳定同位素标记方法可以通过以下步骤进行：标记添加：选择一个含有13C的标记剂，例如13C标记的秸秆、畜禽粪便、生物炭、有机肥等。将该标记剂添加到土壤中，使其与土壤中的有机碳或无机碳发生反应，并与土壤碳库中的碳混合。土壤样品采集：在标记添加后的一段时间内，采集土壤样品。这段时间的长度取决于所关心的碳转化速率，可以是几天、几周，甚至几个月。土壤碳分离：从采集的土壤样品中分离出不同的碳池，例如土壤有机质、微生物生物量碳、无机碳等。同位素分析：对不同的碳池样品进行同位素分析，测量样品中13C的含量。通过测量同位素的比例，可以确定标记剂（13C）的相对贡献以及标记剂的碳在土壤中的转化情况。根据同位素分析的结果，可以推断不同碳池之间的碳转化速率、碳周转通路以及不同碳来源（如植物残体、土壤有机质等）在土壤碳循环中的作用。山东玉米同位素标记秸秆丰度控制稳定同位素标记秸秆是重要科研材料。
15N同位素标记生物炭研究生物炭中氮元素的生物有效性。生物炭是秸秆在无氧或缺氧条件下高温裂解形成的高含碳物质。生物炭也称为生物质炭（biochar），黑碳（blackcarbon）。生物炭中含有大量氮，其有效性深受关注。试验采用15N标记秸秆制成15N标记生物炭，生物炭中15N丰度为7.88%。研究结果表明生物炭中的氮在红壤中的有效性为0.67%，在下位砂姜土中为1.50%.生物炭处理中氮肥在红壤中的利用率为18.75%，在下位砂姜土中为33.77%，分别低于不施生物炭的24.32%和41.74%。
秸秆是一种主要的稻田有机原料。依靠秸秆碳生长的微生物尚未得到很好的研究。有学者利用13C标记的秸秆应用于淹没的水稻进行土壤微宇宙，并分析土壤和渗滤水中的磷脂脂肪酸（PLFA），以追踪秸秆碳如何被微生物的同化。在培养的第3天，土壤和水中的PLFA明显富含13C，这表明秸秆来源的碳立即结合到微生物生物量中。渗滤水中也富集13C标记的PLFA，这一结果表明，除了定居在秸秆上的微生物群落外，可能还有其他的微生物也吸收了秸秆来源的碳。根据PLFA的碳13同位素数据，微生物种群可分为两个群落：依靠秸秆碳的微生物群落和依靠土壤有机质的微生物群落。两个群落的PLFA组成不同，这表明稻草来源的碳被一部分微生物种群同化。渗透水中秸秆来源的PLFA的组成也与依靠土壤有机质的PLFA有所不同。利用稳定同位素标记 秸秆探究秸秆碳氮去向。
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