超微量RNA甲基化热点

PNAS|8-oxoG在mRNA中的积累可以改变哺乳动物细胞中的蛋白质翻译发表时间：2018年4月17号影响因子：9.412PNAS杂志发表了来自国家老年医学中心、北京医院研究的一篇有关O8G氧化修饰改变哺乳动物细胞中蛋白合成的研究成果。文章题目为“Transcriptionalmutagenesismediatedby8-oxoGinducestranslationalerrorsinmammaliancells”。哺乳动物细胞内形成的活性氧可以在mRNA中产生8-oxoG修饰，这一氧化修饰在基因表达过程中会导致碱基错配。本研究首先构建了一种基于超敏荧光素酶Gluc（Gussialuciferase）的报告基因检测系统，通过第二代测序技术发现当RNA中8-oxoG含量增加使U-to-G位点增加，从而诱导表达淀粉样前体蛋白的淀粉样β肽（老年痴呆的重要标志物）。该研究结果表明，8-oxoG在mRNA中的积累可以改变哺乳动物细胞中的蛋白质合成。本论文的发表为深入氧化修饰与蛋白合成间的分子机理提供了全新的研究思路！2’-O-RNA甲基化是一种受RNA甲基化酶或纤维蛋白酶作用下。超微量RNA甲基化热点

云序优势单碱基分辨可对2’-O-RNA甲基化修饰进行单碱基定位。高通量检测可对全转录组范围内的2’-O-RNA位点进行高通量地平行检测。全分子覆盖可较全地对mRNA、LncRNA、pri-miRNA、tRNA和rRNA等多类RNA分子的2’-O-RNA甲基化位点进行检测。一站式服务客户需提供组织或细胞，云序生物一站式完成RNA抽提，样品预处理，建库，测序，数据分析全套流程。专业的生物信息学分析专业的生物信息学团队，能够满足客户的各类深入数据分析需求。m5C RNA甲基化研究云序生物自2018年推出了超微量RNA甲基化测序。

云序优势单碱基分辨m7GRNA甲基化单碱基测序方式，可对m7G甲基化修饰进行单碱基定位。抗体富集效率高m7GMeRIP测序方式，采用预验证的商业化抗体和精心优化的实验流程，具有极高的效率和特异性。高通量检测可对全转录组范围内的m7G位点进行高通量地平行检测。全分子覆盖地对环状RNA、mRNA、lncRNA、pri-miRNA、tRNA和rRNA等多类RNA分子的m7G位点进行检测。一站式服务客户需提供组织或细胞，云序生物一站式完成RNA抽提，样品预处理，建库，测序，数据分析流程。专业的生物信息学分析专业的生物信息学团队，能够满足客户的各类深入数据分析需求

样本要求1）样品类型：细胞、新鲜组织或RNA样品。2）样品量：细胞：2×107组织：500mg-1gRNA：30-300μg，浓度不低于100ng/μL3）RNA质量要求：OD260/280：1.8~2.1浓度≥100ng/μlRNA无明显降解（28S:18S≥1.5或者RIN≥7）4）样品保存：新鲜组织可用RNA保护剂处理或液氮冻存后，-80℃保存。细胞样品，离心收集细胞沉淀后用PBS洗2遍，直接-80℃保存；RNA样品可溶于乙醇或RNA-free的超纯水中，-80℃保存。样品保存Note:样品保存期间避免反复冻融。5）样品运输：样品置于1.5mlEppendorf管或冻存管中，封口膜封好，装在塑料袋中，干冰运输。m6A修饰在各种真核生物、各类组织细胞中普遍存在。

目前还没有一种完善的方法可以在单碱基分辨率下对每个转录本进行m6A的鉴定，这对评估m6A丰度是必要的。作者开发了一种新的方法，称为Nanom6A，用于在单碱基分辨率下鉴定和定量m6A修饰，使用基于XGBoost模型的纳米孔直接RNA测序。并使用MeRIP-Seq和m6A-REF-seq验证了此方法，证实了较高的准确性。利用这种方法，作者进行了毛果杨茎分化木质部中转录组范围的m6A修饰定量分析，揭示了不同的可变聚腺苷酸化(APA)量会导致不同的m6A修饰比例。m7G RNA甲基化修饰能够调节mRNA的转录。海南rDNA甲基化

目前对m6A RNA流行检测手段为MeRIP-Seq技术。超微量RNA甲基化热点

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