tRNA甲基化检测

云序优势一站式服务客户只需提供组织、细胞、体液样品或RNA，云序生物为您完成从ac4CRNA富集，文库制备，上机测序到数据分析整套服务流程。抗体富集效率高acRIP-seq的富集效率是决定数据质量的关键，云序生物acRIP-seq实验采用预验证的商业化抗体和精心优化的实验流程，具有极高的效率和特异性。分子全覆盖可检测mRNA、circRNA、LncRNA、pri-miRNA、rRNA、tRNA等多类RNA分子ac4C乙酰化位点。严格的质控云序生物对acRIP-seq实验每一步骤均设有关键质控，全程监控实验质量，保证客户得到数据。专业的生物信息学分析云序生物拥有专业的生物信息分析团队，帮助客户进行实验数据的挖掘。RNA乙酰化测序与转录组联合应用可整合RNA乙酰化数据和转录组数据进行生物信息学关联分析，揭示RNA乙酰化对基因表达调控的影响，深入挖掘RNA乙酰化的功能。Nature正刊发表文章，证实发生m6A RNA甲基化修饰可以调控mRNA稳定性。tRNA甲基化检测

案例1:m6Am测序揭示了人类转录组中m6Am甲基化的动态性原文：m6Am-seqrevealsthedynamicm6Ammethylationinthehumantranscriptome期刊：NatureCommunication影响因子：13.78北京大学的研究人员开辟了一种新型的m6Am修饰RNA的测序方法，使用抗体拉取5’帽子片段富集m6Am修饰的RNA区域，再在特定生化环境条件下使用FTO酶来区分m6Am与m6A修饰，进而可达到精细至单碱基水平的m6AmRNA测序。使用该方法对人类转录组测序的结果显示，m6Am修饰的分布主要局限于mRNA5’帽子下游的翻译起始位点，并且多数具有BCA的序列motif特征（B=C/U/G）。对细胞施予热激、低氧等应激性刺激时，细胞转录组的m6Am水平有明显上升，说明RNA的m6Am动态修饰可能参与了细胞应激性反应。针对低氧环境刺激的进一步GO分析显示，m6Am水平升高的基因与内质网应激调节的生物学过程有关。广西lncRNA甲基化核糖RNA在2’位置上发生甲基化的化学修饰。

Nature | miR-1的位置特异性氧化导致心脏肥大 发表时间：2020年8月5日 影响因子：42.778 Nature上发表的来自韩国高丽大学Sung Wook团队的一篇研究在氧化还原相关疾病心肌肥大的大鼠模型中对氧化的miRNA进行了特异性测序研究。 作者在氧化还原相关疾病心肌肥大的大鼠模型中对氧化的microRNA（miRNA）进行了特异性测序。结果发现8-氧代鸟嘌呤2（o8G）修饰是选择性地在miRNA的特殊区域（位置2-8）产生的，并通过o8G-A碱基互补配对来调节其他mRNA。用肾上腺素能激动剂医治后主要在miR-1（7o8G-miR-1）的第7位诱导了o8G氧化修饰。单独引入的7o8G-miR-1或7U-miR-1（其中7位的G被U取代）足以引起小鼠心脏肥大，o8G-miR-1的mRNA靶基因在受影响的表型中起作用，反之对小鼠心肌细胞7o8G-miR-1的特异性抑制可减轻心脏肥大。o8G-miR-1也与心肌病患者有关。本研究表明miRNA的位置特异性氧化可以作为表观转录机制来协调病理生理学氧化还原介导的基因表达，为研究氧化修饰在病理生理学中的作用提供了新的思路。

在这篇文章中，发现番茄果实成熟过程中，mRNA m6A甲基化表现出与DNA甲基化相似的动态变化。RNA甲基组分析表明，m6A甲基化是番茄果实mRNA中普遍存在的修饰，且m6A位点富集于终止密码子周围和3'UTR区。在具有DNA超甲基化的成熟缺陷表观突变体无色非成熟(Cnr)的果实中，有1100多个转录本显示m6A水平升高，而只有134个转录本显示m6A水平降低，表明m6A的整体水平升高。m6A沉积通常与转录本丰度呈负相关。云序优势 一站式服务： 客户只需提供细胞、组织或RNA，云序生物为您完成从MeRIP富集，文库制备，上机测序到数据分析整套服务流程。m6A甲基化已经被证明与植物对病原体的抗性有关。

m5C RNA是近年来发现的一类在tRNA及rRNA高丰度存在的甲基化修饰。利用高通量测序手段验证了非编码RNA以及部分mRNA中m5C存在，但是在不同物种、不同组织中m5C修饰分布图谱尚没有系统性报道。云序生物率先开展m5C RNA甲基化测序服务，采用经典重亚硫 酸盐处理的方式进行测序。在全转录范围内及tRNA水平查看基因m5C甲基化修饰水平。 通过高通量测序和生物信息分析，识别甲基化富集的基因组区域。 富集峰识别后，得到的是一堆基因组位置信息，通过生物信息分析利用邻近基因对富集峰进行注释，并根据峰中点相对于已知基因的位置，将富集峰为启动子峰、上游峰、内含子峰、外显子峰、基因间峰。2’-O-RNA甲基化是一种受RNA甲基化酶或纤维蛋白酶作用下。甘肃ctDNA羟甲基化

m6A是真核生物mRNA上常见的一种转录后修饰。tRNA甲基化检测

技术原理 为了系统性揭示RNA O8G氧化修饰，云序生物提供了成熟的 RNA O8G氧化MeRIP-Seq技术服务。技术原理如下：将RNA O8G氧化特异性抗体与被随机打断的RNA的片段进行共孵育，抓取有O8G氧化修饰的片段进行测序；同时需要平行测序一个对照（Input）样本，对照样本为未进行IP反应的RNA的片段。对照样本用于消除非特异性抓取O8G氧化片段的背景。对比免疫共沉淀IP样本和Input样本中的序列片段，将O8G氧化修饰位点定位到转录组上，并根据RNA-seq数据，计算样本中O8G氧化程度。 配合专业的生物信息学分析，云序生物可进一步提供高精度的O8G氧化图谱，帮助客户揭示O8G氧化在生物学功能和潜在的作用机制。tRNA甲基化检测

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