黑龙江ctDNA羟甲基化

案例1：m5CRNA甲基化调控mRNA出核新机制原文：5-methylcytosinepromotesmRNAexport—NSUN2asthemethyltransferaseandALYREFasanm5Creader期刊：CellResearch影响因子：15.60中科院汪海林等研究团队揭示了m5C修饰在mRNA的分布图谱规律及其对调控mRNA出核作用新机制。研究人员建立了改进的RNAm5C单碱基分辨率高通量测序与生物信息分析技术，以此揭示mRNAm5C的分布规律，并绘制了精细的m5C修饰图谱，发现m5C在mRNA的翻译起始位点下游有明显富集，并且主要分布于CG富集区域。通过分析对比人和小鼠不同组织，发现m5C在mRNA上的分布特征在哺乳动物中十分保守，而在不同组织中修饰的基因具有特异性。研究团队同时发现，在小鼠睾丸发育过程中，动态的m5C修饰基因明显富集于精子发育相关功能，提示m5C修饰参与生殖发育调控。RNA去甲基化可以提高水稻和马铃薯植株的产量和生物量。黑龙江ctDNA羟甲基化

研究表明，RNAm6A修饰影响mRNA的转录、定位、翻译、稳定性、剪接和核输出。然而，转录组m6A谱及其在白菜热胁迫中的潜在生物学作用尚缺乏足够的资料。通过MeRIP-seq获得白菜中RNAm6A修饰的first转录组全谱。同时，通过分析Input测序数据获得转录组数据。发现在正常组(CK)和热应激组(T43)中鉴定出11252个m6A共有峰和9729个含有m6A的共有基因。且CK组和T43组中，m6A峰均在3’UTR区高度富集。大约80%的基因有一个m6A位点。m6A峰的共识基序为AAACCV(V:U/A/G)。此外，关联分析发现m6A的甲基化程度与转录水平存在一定的相关性，说明m6A在基因表达中起一定的调控作用。m7G+m3C RNA甲基化差异云序生物为您带来一种基于酶学方法的 DNA 甲基化测序技术 EM-seq。

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mRNAm6Am-Exo-seq测序服务云序生物在国内首批引入m6Am-Exo-seq测序服务，利用5’核酸外切酶消除非目的性的RNA的片段上m6A修饰的信号干扰，选择性地获取mRNA5’帽子结构下游m6Am修饰富集区域的序列信息。对选择性获取到的m6Am修饰的RNA的片段进行反转录建库和高通量测序，可为后续的生物信息学分析提供丰富的数据，进而揭示差异性m6Am修饰位点的特征及其可能的生物学功能，为您的科研课题提供强劲的助力。云序优势一站式服务：客户只需提供细胞、组织或RNA，云序生物为您完成从MeRIP富集，文库制备，上机测序到数据分析整套服务流程。云序生物自2018年推出了超微量RNA甲基化测序。

案例：mRNA中胞嘧啶核苷乙酰化促进其翻译效率原文：AcetylationofCytidineinmRNAPromotesTranslationEfficiency期刊：Cell影响因子：36.22美国ai症研究所（NCI）和弗雷德里克实验室，发现下调NAT10（RNA乙酰化酶）能够抑制Hela细胞的行为；并且ac4C是由NTA10催化的mRNA修饰，下调NAT10后，ac4C的总体水平下降；为了进一步探究ac4C的功能，作者对WT和下调NAT10的Hela细胞进行acRIP-seq和mRNA测序，发现ac4C的peak主要富集在mRNA的CDS区，同时下调NAT10能够降低ac4C在mRNA中的定点表达，并与靶mRNA的下调有很大关系；作者又进一步发现ac4C乙酰化修饰能够通过延长mRNA的半衰期并促进mRNA的稳定性，同时也能够通过ac4Cpeak中的密码子偏好性表达，决定并影响mRNA的解码效率，促进底物翻译。这些发现不仅扩大了mRNA修饰范围（包括乙酰化残基），也确立了ac4C在mRNA翻译调控中的作用。包括：mRNA 5’帽子结构、mRNA内部、pri-miRNA、转运RNA（tRNA）和核糖体RNA（rRNA）。江苏m5C RNA甲基化

m6A甲基化是番茄果实mRNA中普遍存在的修饰。黑龙江ctDNA羟甲基化

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