CUT&Tag 有望将蛋白与染色质 DNA 互相作用的研究变成了一种类似 PCR 反应的常规操作,对基因调控、表观遗传等领域的研究具有**性的意义 在生物学研究中,DNA 与蛋白质之间的相互作用(DNA-Protein Interaction, DPI)是至关重要的,基因的表达、调控、复制、重组和修复,RNA 的转运、翻译和调控,都离不开 DPI,几乎所有的生命活动都会涉及 DPI。 早在十九世纪后期,科学家就通过显微镜观察到了蛋白质与 DNA 直接的相互作用,从那以后,他们开始深入探索蛋白质结合并控制 DNA 的作用机制。可用于协助评估用药疗效、复发及医治后期转移动态的监测。黑龙江项目表观遗传组测序结果
游离于染色体基因组之外的DNA(extrachromosomalDNA,ecDNA)被发现常常以环状的形式存在,这种形式的DNA被称为环状DNA(extrachromosomalcircularDNA)。目前也习惯将巨大的环状DNA(>1Mb)称为ecDNA,而将相对较小的环状DNA称为eccDNA。环状DNA连登《Nature》《Cell》等期刊,彻底颠覆了人们对基因遗传的传统认知,成为了很有潜力的科研新热点。云序生物环状DNA甲基化测序技术基于转座酶和m5C位点酶学转化方法,用核酸外切酶V消化以去除线性DNA。通过转座酶打开环状DNA的环形结构,并在DNA的片段的两端加上接头。通过Klenow酶修复转座产物的末端缺口。通过温和的酶转化法,将未甲基化的胞嘧啶(C)高效地转化为尿嘧啶(U),后续进行文库构建与高通量测序,从而获得发生甲基化修饰的环状DNA。该技术可以同时检测环状DNA和环状DNA的甲基化修饰状态,为环状DNA的深入研究及新型分子标志物的开发提供了新的技术手段。上海项目表观遗传组测序为环状DNA的深入研究及新型分子标志物的开发提供了新的技术手段。
CUT&Tag技术的基本原理为:在抗体引导下,ChiTag酶在目的组蛋白修饰标志、或转录因子、或染色质调控蛋白结合染色质的局部进行目的DNA的片段化,同时添加测序接头,并释放到细胞外,而绝大部分无关的染色质还留在细胞核内,因而整个实验的信噪比大幅提高,同时简化了实验步骤。该方法可一管式高通量应用,并可与单细胞测序平台"无缝"结合。ChiTag酶在打断基因组的同时加上接头,不需要繁琐的补平加A加接头,在一个工作日内可以完成从细胞到测序文库制备全流程。
案例:hMeDIP-seq揭示了心机细胞发育与肥大过程中的基因表达与5hmC有关 DNA hydroxymethylation controls cardiomyocyte gene expression in development and hypertrophy[J].Greco C M, Kunderfranco P, Rubino M, et al . Nature Communications, 2016, 7:12418. 5-hmC(DNA羟甲基化)在基因体上富集能够激huo基因的转录调控,但对启动子和远端调节区的功能不太清楚。本文主要是以不同发育时间点和心肌肥大的心肌细胞为实验载体,主要剖析5-hmC在心肌细胞(CMC)基因组中的分布,并揭示了5-hmC在心脏发育和疾病中的作用机制。1)通过DNA羟甲基化测序,作者发现在心脏发育过程中,CMCs中的5-hmC在基因间区域逐渐减少,并向GB上富集(图1)。2)通过DNA羟甲基化和转录组关联分析,作者得出5-hmC是CMCs发育和肥大过程中的重要调控因子(图2)。该团队基于转座酶和m5C位点酶学转化方法开发出了环状DNA甲基化测序技术。
优势一:一站式服务。客户只需提供样本,云序生物为您完成从ctDNA提取,文库制备,上机测序到数据分析整套服务流程。优势二:超微量ctDNA起始量要求。云序生物可以进行低至10ng的ctDNA测序。优势三:测序数据真实可靠。云序生物避免了传统5mC检测方法的GC覆盖度偏误,还拥有更完整的DNA读长,文库质量更加可靠。优势四:严格质控流程:云序生物质控流程严格,层层把关,为客户提供高准确度的结果。优势五:专业化生物信息分析:云序生物强大生物信息团队,满足客户个性化数据分析要求。传统观点认为真核基因组通常形成稳定的线性染色体。湖南平台表观遗传组测序价格
甚至会对传统遗传学和基因组学带来**性影响。黑龙江项目表观遗传组测序结果
技术简介 DNA甲基化能控制基因表达,因而在动植物的生长发育过程中发挥着关键的调控作用,并且与包括ai症在内的多种人类疾病密切相关,是表观遗传学研究的热点。 云序生物提供的MeDIP测序服务,将甲基化DNA免疫共沉淀技术(MeDIP)和高通量测序相结合,能够帮助客户快速地获取全基因组范围内的DNA甲基化图谱,并比较不同样品中的甲基化分布差异。配合强大的生信分析实力,我们提供的不仅是海量的测序数据,而且是根据您的研究目的,有针对性地挖掘提炼出取之即可用的结果及出版级图片。黑龙江项目表观遗传组测序结果
上海云序生物科技有限公司是以提供RNA甲基化,表观遗传学,转录组测序,外泌体为主的私营有限责任公司,公司始建于2015-03-02,在全国各个地区建立了良好的商贸渠道和技术协作关系。云序生物致力于构建商务服务自主创新的竞争力,多年来,已经为我国商务服务行业生产、经济等的发展做出了重要贡献。