江苏云序表观遗传组测序分子

ctDNA/cfDNA 之所以引起学界这么大的研究热情，与其在临床上广阔的应用前景是分不开的。相比于目前tumsor诊断当中普遍使用的组织活检，ctDNA 测序对患者的伤害小，且可以多次、实时地进行提取检测，在临床运用上具有极大的优势，有助于ai症的早发现、早医治，被誉为“液体切片活检”。ctDNA 的甲基化检测，同时结合了 ctDNA 测序于 DNA 甲基化测序的优势，在ai症检测方面提供更好的特异性和灵敏度。在 2021 年，已有 ctDNA/cfDNA 甲基化测序相关的商业化产品面市在治 疗过程中，ctDNA甲基化水平与ai细胞数量呈正比。江苏云序表观遗传组测序分子

样本要求样品类型：细胞、组织、体液、总gDNA或IP后DNA。其它类型样品请详询。样品量：a）细胞5×108b）组织100mgc）IP后DNA10ngd）gDNA3μg样品运输及保存：样品运输：样品置于1.5mLEppendorf管中，封口膜封好，干冰运输，DNA可用冰袋运输。样品保存：细胞样品或新鲜组织块切块，液氮冻存后-80℃保存；DNA样品短期内可-20℃，避免反复冻融。云序生物提供的MeDIP测序服务，将甲基化DNA免疫共沉淀技术（MeDIP）和高通量测序相结合，能够帮助客户快速地获取全基因组范围内的DNA甲基化图谱，并比较不同样品中的甲基化分布差异。湖南研究表观遗传组测序研究云序生物具有丰富样本处理经验，采用ctDNA提取试剂盒，富集效率高。

案例2：解析转录因子结合 原文：Cell-type specific and combinatorial usage of diverse transcription factors revealed by genome-wide binding studies in multiple human cells 期刊：Genome Research 影响因子：10.10 本文通过ChIP测序系统性地调查了11种不同类型人类细胞中3种转录因子（CTCF、RNAPII和MYC）与基因组的结合情况。结果表明：CTCF主要结合在基因间区，而RNAPII和MYC则偏向于结合在启动子区。CTCF结合位点在不同类型细胞中往往没有多大变化，而MYC的结合则呈现强烈的细胞特异性。MYC和RNAPII在很多区域共定位，并具有很多共同的靶基因。此外，通过整合转录组测序数据发现：转录因子结合与潜在靶基因的表达正相关，多个转录因子的组合结合，尤其是MYC和RNAPII的同时结合与基因高表达有着很强的关联性。

由于通常的活检技术不能够描述分子特性，因此胰腺ai和胆道ai患者通常缺少个性化的治疗方案。而游离的DNA测序能够帮助这部分人群进行医疗。在EricA.Collisson教授的研究中，他们分析了26名患者tumsor中的54个基因。除了9名患者测序失败，剩下的17名患者中，90.3%的tumsor突变都能够在ctDNA中发现。其正确率为97.7%，灵敏度为92.3%，特异性为100%。同时，他们发现，ctDNA与tumsor标记动态是具有相关性的。因此，可以在胰腺cancer和胆道cancer患者中，通过ctDNA测序的方法，来确定患者的tumsor基因型，从而为患者提供准确的靶向疗法。近日，Nature杂志上发表了颠覆性研究成果：在tumsour中，主要的ai基因转录本是直接来自于环状DNA的。

案例1.ATAC-Seq与RNA-Seq关联分析期刊：ThePlantCell影响因子：8.23原文：EGRINs(EnvironmentalGeneRegulatoryInfluenceNetworks)inRiceThatFunctionintheResponsetoWaterDeficit,HighTemperature,andAgriculturalEnvironments本篇文章是利用ATAC-seq与RNA-seq联合分析的经典案例。作者选择5个不同的水稻品种，对它们分别进行热处理和干旱处理以模拟高温和缺水这2种胁迫环境。进一步通过对这种胁迫处理的5个水稻品种进行RNA-seq检测RNA的表达差异和ATAC-seq检测染色质开放区域差异。再联合ATAC-seq数据和RNA-seq数据，以及转录因子的motif信息。构建植物应激的转录因子-靶基因的调控网络图，并寻找关键的转录因子-靶基因模块，预测了关键转录因子活性。完成植物在应激情况下反应相关的转录因子的研究。游离于染色体基因组之外的DNA被发现常常以环状的形式存在，这种形式的DNA被称为eccDNA。广东云序表观遗传组测序内容

该技术可以同时检测环状DNA和环状DNA的甲基化修饰状态。江苏云序表观遗传组测序分子

技术优势一站式服务：客户只需提供样本，云序生物为您完成从ctDNA提取，文库制备，上机测序到数据分析整套服务流程。特异性富集ctDNA的片段：云序生物具有丰富样本处理经验，采用ctDNA提取试剂盒，富集效率高。严格质控流程：云序生物质控流程严格，层层把关，为客户提供高准确度的结果。专业化生物信息分析：云序生物强大生物信息团队，满足客户个性化数据分析要求。样本要求1）样品类型：血清、血浆、体液等。其他样本类型请详询。2）样品量：血清，血浆：≥5mL;体液：请详询。3）样品保存：血清、血浆、体液样品，可用液氮速冻后-80℃保存，样品保存期间避免反复冻融。4）样品运输：样品置于1.5mL管中，封口膜封好，干冰运输。江苏云序表观遗传组测序分子

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