企业商机
表观遗传组测序基本参数
  • 品牌
  • 高通量测序,测序合成,科研,技术服务
  • 公司名称
  • 上海云序生物科技有限公司
  • 行业类型
  • 生物
  • 安全质量检测类型
  • 测序
  • 所在地
  • 北京,海南,上海,河北,广州,河南,湖北,深圳,成都,湖南,杭州,吉林,南京,江苏,天津,江西,武汉,辽宁,重庆,宁夏,安徽,青海,中国澳门,山东,福建,山西,甘肃,陕西,广东,四川,广西,中国台湾,贵州,西藏,内蒙古,黑龙江,浙江,云南,新疆,香港
  • 检测类型
  • 测序
表观遗传组测序企业商机

案例1:小肠腺ai的特异性甲基化组图谱本文通过MeDIP测序研究了小鼠模型小肠腺ai起始过程中的甲基化变化,发现了13,000多个与小肠腺ai发生相关的差异甲基化区(DMRs)。进一步分析发现:组蛋白修饰复合物PRC2的靶基因在高甲基化DMRs中明显富集,说明组蛋白修饰与DNA甲基化密切相关。此外,在不同类型细胞中,通过重亚硫酸盐焦磷酸测序证实:这些DMRs是腺ai细胞中全新形成的,而不是通过小肠干细胞或未分化隐窝细胞中已有甲基化模式的扩展形成的。更为有趣的是,作者发现了一些DMRs,它们在小鼠腺ai和人类结肠ai间是保守的,并因此找到了一些在结肠ai中受表观遗传修饰的基因,揭示了甲基化修饰作为临床分子标志物的潜力。ai症组中ctDNA甲基化水平与正常组差异明显。贵州云序表观遗传组测序价格

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案例1.ATAC-Seq与RNA-Seq关联分析期刊:ThePlantCell影响因子:8.23原文:EGRINs(EnvironmentalGeneRegulatoryInfluenceNetworks)inRiceThatFunctionintheResponsetoWaterDeficit,HighTemperature,andAgriculturalEnvironments本篇文章是利用ATAC-seq与RNA-seq联合分析的经典案例。作者选择5个不同的水稻品种,对它们分别进行热处理和干旱处理以模拟高温和缺水这2种胁迫环境。进一步通过对这种胁迫处理的5个水稻品种进行RNA-seq检测RNA的表达差异和ATAC-seq检测染色质开放区域差异。再联合ATAC-seq数据和RNA-seq数据,以及转录因子的motif信息。构建植物应激的转录因子-靶基因的调控网络图,并寻找关键的转录因子-靶基因模块,预测了关键转录因子活性。完成植物在应激情况下反应相关的转录因子的研究。河北研究表观遗传组测序是什么后续进行文库构建与高通量测序,从而获得发生甲基化修饰的环状DNA。

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技术简介DNA甲基化修饰是表观遗传研究的热点之一,我们通常认为DNA甲基化就是胞嘧啶甲基化(5-methylcytosine,5mC),却不知道随着测序技术的快速发展,一种新的DNA甲基化修饰类型—DNA-6mA甲基化已经成为表观遗传学领域的研究热点。云序生物率先开发了DNA-6mA测序技术—6mA-IP-seq。其原理类似于MeDIP的免疫共沉淀测序技术,利用特异性抗体富集6mA的片段,扩增后进行高通量测序及甲基化分析,以较小的数据量,快速地绘制全基因组DNA甲基化水平的图谱。

样品类型:tumsor患者的血浆、血清或cfDNA。血浆和血清相比较而言,推荐使用血浆,以减少淋巴细胞来源的cfDNA干扰。样品量:血浆>5mL;血清>10mL;cfDNA>10ng。血浆提取:使用EDTA抗凝管收集全血,切勿冷冻保存,只能在2-8℃冰箱短暂存放,并尽快进行低温离心获取血浆。若不能进行低温离心,则需要使用添加专有稳定剂的STRECK无创管来保存全血,可在常温条件下离心。为了消除残留的细胞,血浆需要进行二次离心:first在4℃条件下以1600g离心10分钟;第二次在4℃条件下以16000g离心10分钟。样品保存:血浆、血清样品液氮速冻后-80℃冰箱保存。样品保存期间避免反复冻融。样品运输:封口膜封好样品,干冰运输。通过温和的酶转化法,将未甲基化的胞嘧啶(C)高效地转化为尿嘧啶(U)。

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1、DNA甲基化富集峰的识别通过高通量测序和生物信息分析,识别甲基化富集的基因组区域,默认p<=1e-5(具体参数以报告为准,云序生物会根据数据,适当调整参数)的峰为统计上明显的甲基化区注:每个样品组做一个Input,以去除基因组背景,降低假阳性率2、DNA甲基化区域富集峰的注释富集峰识别后,得到的是一堆基因组位置信息,通过生物信息分析利用邻近基因对富集峰进行注释,并根据峰中点相对于已知基因的位置,将富集峰为启动子峰、上游峰、内含子峰、外显子峰、基因间峰ctDNA甲基化与ai症发展各时期关系密切,特别是ai症早期。辽宁分析表观遗传组测序结果

同时检测环状DNA及其甲基化状况,节约样品,性价比高。贵州云序表观遗传组测序价格

技术简介 DNA甲基化能控制基因表达,因而在动植物的生长发育过程中发挥着关键的调控作用,并且与包括ai症在内的多种人类疾病密切相关,是表观遗传学研究的热点。 云序生物提供的MeDIP测序服务,将甲基化DNA免疫共沉淀技术(MeDIP)和高通量测序相结合,能够帮助客户快速地获取全基因组范围内的DNA甲基化图谱,并比较不同样品中的甲基化分布差异。配合强大的生信分析实力,我们提供的不仅是海量的测序数据,而且是根据您的研究目的,有针对性地挖掘提炼出取之即可用的结果及出版级图片。贵州云序表观遗传组测序价格

上海云序生物科技有限公司是一家集研发、制造、销售为一体的****,公司位于上海市松江区新桥镇莘砖公路518号20幢302室-2,成立于2015-03-02。公司秉承着技术研发、客户优先的原则,为国内RNA甲基化,表观遗传学,转录组测序,外泌体的产品发展添砖加瓦。在孜孜不倦的奋斗下,公司产品业务越来越广。目前主要经营有RNA甲基化,表观遗传学,转录组测序,外泌体等产品,并多次以商务服务行业标准、客户需求定制多款多元化的产品。上海云序生物科技有限公司每年将部分收入投入到RNA甲基化,表观遗传学,转录组测序,外泌体产品开发工作中,也为公司的技术创新和人材培养起到了很好的推动作用。公司在长期的生产运营中形成了一套完善的科技激励政策,以激励在技术研发、产品改进等。上海云序生物科技有限公司严格规范RNA甲基化,表观遗传学,转录组测序,外泌体产品管理流程,确保公司产品质量的可控可靠。公司拥有销售/售后服务团队,分工明细,服务贴心,为广大用户提供满意的服务。

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