化肥中不含有机质、腐殖质，因此大量使用化肥，土壤由于有机质和腐殖质的缺乏，土壤团粒结构遭到破坏，造成土壤板结，农植物产量下降。
化肥利用率低，氮肥因为易挥发、流失，利用率只有30%-50%，磷肥的利用率才10%-25%，因为磷酸根化学活性活泼，施入土壤后大部分磷与土壤中的Zn2+、Mg2+、Ca2+、Fe3+、Al3+等阳离子结合形成难溶性磷肥。钾的利用率也只有50%左右。
化肥大量使用使蔬菜瓜果品质**下降。由于作物不仅只需要氮磷钾，同时还需要钙铁锌硒等许多微量元素，而化肥一般成分比较单一，所以长期使用化肥必然导致土壤中所含养分趋于单一，易使作物营养失调，从而导致作物内部转化合成受阻，必然导致作物品质下降，瓜不甜，菜不香。
危害人体健康。大量施用化肥，易使蔬菜中硝酸盐含量超标，而亚硝酸盐与胺类物质结合形成N-亚硝酸基化合物为强致*物质。
化肥的大量使用，还造成土壤的有益菌、蚯蚓的大量死亡。
化肥的长期低效施用，往往造成土壤中某些元素的过分积累和土壤理化性质的变化及环境的污染。
从中国大量使用化肥看，越使用化肥，地力就越下降，就越依赖化肥，由此形成恶性循环。
但目前菌、功能菌、活菌、基础菌、总菌数、菌落数、根际细菌，五花八门的叫法很多。福建功能性生物菌肥咨询报价
认为一种产品中菌的种类越多、菌种数量越大越好复合菌剂的使用效果会受到不同菌种生长习性的影响，盲目的复合，极易造成菌种间的拮抗，影响效果发挥。产品使用后起作用的只有活菌，因此菌衡量的标准为“有效活菌数（CFU）”，有效活菌数量越大效果越好。此外，菌的纯度也至关重要，当产品中霉菌杂菌数及杂菌率超标时也会影响应用。市场上少数不合格产品中含有致病菌，不仅修复不了土壤，还会导致病害发生。不能与农药混用。化肥农药大面积混在一起的时候很可能会把菌杀死，施了生物菌肥以后，接着倒上杀菌药，海南便宜生物菌肥品质保障生物菌肥是农业生产中使用肥料的一种。
误区2：种类混乱，分不清使用的是菌剂还是菌肥农用微生物菌剂是指目标微生物（有益菌）经过工业化生产扩繁后制成的活菌制剂；微生物菌肥包含复合微生物肥料和生物有机肥，分别指目的微生物经工业化生产增殖后与营养物质和主要动植物残体（如畜禽粪便、农作物秸秆等）为来源并经无害化处理的有机物料复合而成的活菌制品。菌剂、菌肥比较大的区别在于产品中营养物质及有机物料的含量，使用中需结合实际需求选择对路产品。误区3：认为一种产品中菌的种类越多、菌种数量越大越好复合菌剂的使用效果会受到不同菌种生长习性的影响，盲目的复合，极易造成菌种间的拮抗，影响效果发挥。产品使用后起作用的只有活菌，因此菌衡量的标准为“有效活菌数（CFU）”，有效活菌数量越大效果越好。此外，菌的纯度也至关重要，当产品中霉菌杂菌数及杂菌率超标时也会影响应用。市场上少数不合格产品中含有致病菌，不仅修复不了土壤，还会导致病害发生。
曾经就有个陕西咸阳的果友来咨询我们说，他家的生物菌用下去20天了，但是却没有任何作用，为什么呢？仔细一问才知道，他把生物菌埋进土里头之后，就没有再理会了，在太阳晒得土都能冒的情况下依然没有浇水。这种情况下，生物菌肯定是不能活的了，更不要说繁殖了。这位果友又问，那为什么生物菌在同样没有水和营养了的包装袋里能活呢？这完全是两码事。就像我们前面提到的，生物菌在包装袋里是处于休眠状态的，不需要水分和养分。所以大家一定要注意这些生物菌的正确使用。很多情况下，不是它不管用，而是我们没有用好而已。菌剂、菌肥比较大的区别在于产品中营养物质及有机物料的含量，使用中需结合实际需求选择对路产品。
综上所述，从官方发布的标准里，我们看到《农用微生物菌剂GB20287-2006》是没有有机质、氮磷钾的要求。但是菌含量、杂菌率等质量要求，是比执行《生物有机肥NY884-2012》类的要求高得多，如果是用普通生物有机肥料NY884-2012来冒充生物菌肥GB20287-2006标准，你可以举报它了。如果你买的产品是“生物有机肥”，而执行“农用微生物菌剂”的国家标准，等于是该产品的技术参数提高了10倍；同时，它的原料必须经过高温灭菌才能保证杂菌率达标（一般的有机质中杂菌含量都超标）。这些都大幅度增加它的成本，好多厂家并没有按要求来做，所以提醒各位老乡，价格和价值往往是成正比的，千万不要贪小便宜，吃大亏，用生物菌肥的钱买了普通的生物有机肥料。一种看法认为它肥效很高，把它当成肥料，甚至扬言可以完全取代化肥；山西湿地生物菌肥技术指导
于各种常用化肥·有机肥配合使用，提高肥料的利用率，增产增收效果***。福建功能性生物菌肥咨询报价
微生物的成本应该由三部分组成：有效功能菌、载体和其他添加物菌固然是成本的首要因素，否则就不是菌肥了。但目前菌、功能菌、活菌、基础菌、总菌数、菌落数、根际细菌，五花八门的叫法很多。定义不同，意义就不同，随意抓片树叶就含菌几万，不能说这含菌的树叶就值多少钱。各种定义的菌差异很大，确切的概念应该是有效功能菌；不同的菌种，功能、效果不同，成本也会有很大差异。千万不要被标示的5亿，10亿，甚至15亿的菌含量所蒙蔽，国家标准：微生物菌剂产品颗粒的是≥1亿，液体是≥2亿。生物有机肥是≥0.2亿，是国家相关**经过多年的理论和实践制定的。看到动辄标示的10亿、15亿菌含量的微生物菌肥一定要注意。福建功能性生物菌肥咨询报价
成都盖尔盖司生物科技有限公司是一家集生产科研、加工、销售为一体的****，公司成立于2006-06-14，位于金堂清江镇新水碾村4组。公司诚实守信，真诚为客户提供服务。公司主要经营生物有机肥，菌剂肥，复合微生物肥，有机肥等产品，我们依托高素质的技术人员和销售队伍，本着诚信经营、理解客户需求为经营原则，公司通过良好的信誉和周到的售前、售后服务，赢得用户的信赖和支持。公司秉承以人为本，科技创新，市场先导，和谐共赢的理念，建立一支由生物有机肥，菌剂肥，复合微生物肥，有机肥**组成的顾问团队，由经验丰富的技术人员组成的研发和应用团队。在市场竞争日趋激烈的现在，我们承诺保证生物有机肥，菌剂肥，复合微生物肥，有机肥质量和服务，再创佳绩是我们一直的追求，我们真诚的为客户提供真诚的服务，欢迎各位新老客户来我公司参观指导。
