不同作物种类、同一种类作物的不同品种对养分的需要量及其比例、养分的需要时期、对肥料的忍耐程度等均不同，因此在施肥时应充分考虑每一种作物需肥规律，制定合理的施肥方案。需肥期长、需肥量大的类型这种类型的蔬菜，初期生长缓慢，中后期生长迅速，从根或果实的肥大期至收获期，需要提供大量养分，能维持旺盛的长势。西瓜、南瓜、萝卜等生育期长的蔬菜，大都属于这种类型。这些蔬菜的前半期，只能看到微弱的生长，一旦进入成熟后期，活力增大，像秋天的水稻一样旺盛生长。从养分需求来看，前期养分需要量少，所以基肥选用有机肥特别要求氮含量不要太高，应重在作物生长后期多追肥，尤其是氮肥，但由于作物枝叶繁茂，后期不便施有机肥料。因此，有机肥比较好还是作为基肥，施在离根较远的地方，或是作为基肥进行深施。堆肥过程主要靠微生物的作用进行，微生物是堆肥发酵的主体。河南有机肥菌
有机肥需开沟施入，且要充分和土壤进行接触，不然没有改土作用，还易流失。有机肥的施用位置要靠近吸收根，即树冠**垂直投影处，并适度深施，引根下扎，太近大根不仅不利吸收，还易烧根。施用有机肥时应注意与无机肥、生物菌肥等的配合使用，以满足作物对营养的需求与土壤营养的补充。矿物源有机肥的原料的前体是动植物残体千百年矿化而成风化煤、褐煤，在改良土壤团粒结构、提高矿质营养元素利用率方面效用更佳。生物质有机肥的原料以畜禽粪便及秸秆腐熟为主，富含氨基酸、核酸、多肽、蛋白酶等活性成分，对树体的调理效用更明显。广东生物有机肥物理性质：土壤物理性状的好坏直接关系到土壤养分供给能力的大小。
有机肥含有大量的有机质，具有明显的改土培肥的作用。有机肥含有多种养分，肥效持久，肥料中没有任何化学合成物质，长期施用可以改善农产品品质。有机肥经过充分腐熟处理，施用后可提高作物的抗旱、抗病、抗虫能力，减少农药的使用量。有机肥料中含有大量的有益微生物，可以促进土壤中的生物转化过程，有利于土壤肥力的不断提高。有机肥合理施用有机肥一般作基肥施用，也可作追肥。作基肥时先撒施，然后结合翻地深施均匀。还有就是壅根，蔬菜种植中将腐熟的有机肥壅在作物根部，可以起到促根壮秧的效果。
根据不同质地土壤中有机肥料养分释放转化性能和土壤保肥性能不同，应采用不同的施肥方案。沙土土壤肥力较低，有机质和各种养分的含量均较低，土壤保肥保水能力差，养分易流失。但沙土有良好的通透性能，有机质分解快，养分供应快。沙土应增施有机肥料，提髙土壤有机质含量，改善土壤的理化性状，增强保肥、保水性能。但对于养分含量髙的质量有机肥料，一次使用量不能太多，使用过量也容易烧苗，转化的***养分也容易流失，养分含量高的质量有机肥料可分底肥和追肥多次使用。也可深施大量堆腐秸秆和养分含量低、养分释放慢的粗杂有机肥料。黏土保肥、保水性能好、养分不易流失。但土壤供肥慢，土壤紧实，通透性差，有机成分在土壤中分解慢。黏土地施用的有机肥料必须充分腐熟；黏土养分供应慢，有机肥料应可早施，可接近作物根部。旱地土壤水分供应不足，阻碍养分在土壤溶液中向根表面迁移，影响作物对养分的吸收利用。应大量增施有机肥料，增加土壤团粒结构，改善土壤的通透性，增强土壤蓄水、保水能力。长期单施化肥会被损坏泥土的团粒结构，造成泥土粘重板结，下降耕作性能和供肥性能。
土壤中的微量元素95%以不溶态形式存在，不能被植物吸收利用，而微生物代谢产物中含有大量的有机酸类物质，这些物质就像在冰块中加入的热水一样，很快就能把微量元素钙、镁、硫、铜、锌、铁、硼、钼等植物必需的矿物元素溶解，变成可以被植物直接吸收利用的营养元素，增加了土壤的供肥能力。生物有机肥中的枯草芽孢杆菌等有益微生物利用土壤中的有机质，产生次级代谢物，其中含有大量的促生长类物质。如生长素，能促进植物伸长生长，脱落酸，能促进果实成熟，赤霉素能促进开花坐果，增加开花数、保果率，提高产量，使果实饱满，色泽鲜嫩，还能提早上市，达到增产增收。生物有机肥的枯草芽孢杆菌等有益微生物利用土壤中的有机质，产生次级代谢物，其中含有大量的促生长类物质。河南有机肥菌
数据显示,目前发达国家有机肥施用已占肥料养分总用量的近半,而我国却只占不到10%。河南有机肥菌
畜禽粪便类有机肥料的有机质含量中等，氮、磷、钾等养分含量丰富，由于其来源***，使用量比较大。但由于其加工条件的不一样，其成品肥的有机质和氮、磷、钾养分差别，选购使用该类有机肥料时应注意其质量的判别。以纯畜禽粪便工厂化快速腐熟加工的有机肥料，其养分含量高，应少施，集中使用，一般做底肥使用，也可做追肥。含有大量杂质，采取自然堆腐加工的有机肥料，有机质和养分含量均较低，应做底肥使用，量可以加大。另外，畜禽粪便类有机肥料一定要经过灭菌处理，否则容易给作物和人、畜传染疾病。绿肥是经人工种植的一种肥地作物，有机质和养分含量均较丰富。但种植、翻压绿肥一定要注意茬口的安排，不要影响主要作物的生长。绿肥一般有固氮能力，应注意补充磷钾肥。垃圾类有机肥料的有机质和养分含量受原料的影响，很不稳定，每一批肥料的有机质和养分含量都不一样，一般含量不高，适宜做底肥使用。由于垃圾成分复杂，有时含有大量对人和作物极其有害的物质，如重金属、放射性物质等，使用垃圾肥时对加工肥料的垃圾来源要弄清楚，含有有害物质的垃圾肥严禁施用到蔬菜和粮食作物上，可用于人工绿地和绿化树木。河南有机肥菌
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