福建修饰测序RNA甲基化

血清血浆环状DNA测序游离于染色体基因组之外的DNA(extrachromosomalDNA，ecDNA)被发现常常以环状的形式存在，这种形式的DNA被称为环状DNA(extrachromosomalcircularDNA，eccDNA）。目前也习惯将巨大的环状DNA(>1Mb)称为ecDNA,而将相对较小的环状DNA称为eccDNA。传统观点认为真核基因组通常形成稳定的线性染色体。但新的研究表明：无论是在正常体细胞还是cancer细胞中，都存在大量染色体外环状DNA。目前，环状DNA不只可以作为一种新型特异的tumour标志物，还在tumour发生和发展机理研究中发挥着重大的潜在价值。云序生物提供一站式环状RNA实时定量PCR技术服务。福建修饰测序RNA甲基化

案例1：孕妇血浆中胎儿环状DNA的特征是：呈甲基化状态原文：CharacteristicsofFetalExtrachromosomalCircularDNAinMaternalPlasma:MethylationStatusandClearance期刊：ClinicalChemistry影响因子：8.322近期，NIPT之父卢煜明教授团队开发了一种环状DNA甲基化分析的测序方案，通过对不同产后时间点的胎儿环状DNA含量的评估，研究了胎儿环状DNA的体外clear效率。作者还发现血浆中的胎儿环状DNA与母体环状DNA相比甲基化程度相对较低。此外，和胎儿线性DNA类似，胎儿环状DNA在分娩后从母血中迅速clear。总之，该团队基于转座酶和m5C位点酶学转化方法开发出了环状DNA甲基化测序技术，并揭示了孕妇血浆中的胎儿环状DNA甲基化状况，为环状DNA的深入研究及新型分子标志物的开发提供了新的技术手段。平台测序研究云序生物专注做测序服务，PCR，质谱检测。

样本要求样品类型细胞、组织或RNA，其他样本类型请电询。样品量a)细胞：1×108b)组织：500mg-5gc)RNA：100μg-300μg(OD260/280：1.6-2.3;RNA无明显降解)样品运输及保存样品运输：样品置于1.5mL离心管中，封口膜封好，干冰运输。样品保存：细胞样品或新鲜组织块可用TRIZOL或RNA保护剂处理，液氮冻存后-80℃保存；RNA样品可溶于乙醇或RNA-free的超纯水中，-80℃保存，避免反复冻融。目前，环状DNA不只可以作为一种新型特异的tumour标志物，还在tumour发生和发展机理研究中发挥着重大的潜在价值。

环状DNA连登《Nature》《Cell》等高级期刊，彻底颠覆了人们对基因遗传的传统认知，成为了很有潜力的科研新热点。云序生物环状DNA甲基化测序技术基于转座酶和m5C位点酶学转化方法，用核酸外切酶V消化以去除线性DNA。通过转座酶打开环状DNA的环形结构，并在DNA的片段的两端加上接头。通过Klenow酶修复转座产物的末端缺口。通过温和的酶转化法，将未甲基化的胞嘧啶（C）高效地转化为尿嘧啶（U），后续进行文库构建与高通量测序，从而获得发生甲基化修饰的环状DNA。该技术可以同时检测环状DNA和环状DNA的甲基化修饰状态，为环状DNA的深入研究及新型分子标志物的开发提供了新的技术手段。根据注释信息，绘制富集峰在不同基因组特征上的比例图。

研究还发现，m6Am修饰是一个可逆的动态修饰，当细胞遭遇热激、低氧等应激性刺激时m6Am水平上升，说明m6Am可能在细胞应激反应中扮演了重要角色。近来也有研究发现，除了mRNA的较早编码核苷酸残基以外，在snRNA内部也有m6Am甲基化修饰的分布。虽然m6Am修饰早在1975年就已经被人类发现，但由于检验手段的匮乏，科学家难以区分出m6A修饰与m6A修饰，因此直到近年来m6Am测序技术逐渐发展成熟，才为进一步深入研究m6Am这一重要的RNA修饰铺平了道路。核糖体印迹测序又称Ribosome profiling，或Ribo-seq。新疆修饰测序

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