环状DNA连登《Nature》《Cell》等高级期刊,彻底颠覆了人们对基因遗传的传统认知,成为了很有潜力的科研新热点。云序生物环状DNA甲基化测序技术基于转座酶和m5C位点酶学转化方法,用核酸外切酶V消化以去除线性DNA。通过转座酶打开环状DNA的环形结构,并在DNA的片段的两端加上接头。通过Klenow酶修复转座产物的末端缺口。通过温和的酶转化法,将未甲基化的胞嘧啶(C)高效地转化为尿嘧啶(U),后续进行文库构建与高通量测序,从而获得发生甲基化修饰的环状DNA。该技术可以同时检测环状DNA和环状DNA的甲基化修饰状态,为环状DNA的深入研究及新型分子标志物的开发提供了新的技术手段。RNA抽提,RNA质控,环状RNA特异性引物设计,环状RNA逆转录,环状RNA qPCR检测。黑龙江修饰测序
研究还发现,m6Am修饰是一个可逆的动态修饰,当细胞遭遇热激、低氧等应激性刺激时m6Am水平上升,说明m6Am可能在细胞应激反应中扮演了重要角色。近来也有研究发现,除了mRNA的较早编码核苷酸残基以外,在snRNA内部也有m6Am甲基化修饰的分布。虽然m6Am修饰早在1975年就已经被人类发现,但由于检验手段的匮乏,科学家难以区分出m6A修饰与m6A修饰,因此直到近年来m6Am测序技术逐渐发展成熟,才为进一步深入研究m6Am这一重要的RNA修饰铺平了道路。江苏服务测序RNA甲基化每个样品组做一个Input,以去除基因组背景,降低假阳性率 。
核糖体印迹测序又称Ribosomeprofiling,或Ribo-seq,是运用测序手段研究翻译组学的一种主要的技术手段。该技术通过使用翻译抑制剂使正在翻译的mRNA序列固定在核糖体上。加入核酸酶处理不受核糖体保护的mRNA,分离核糖体并提取纯化核糖体上未被消化的短片段mRNA(大约30nt),进而获得正在翻译的mRNA序列。这项技术可获得实时全转录组正在翻译的序列信息,使研究者能从分子水平检测蛋白组的翻译情况,并了解蛋白质的翻译水平及翻译过程,在蛋白翻译机制的研究领域中有广阔的应用前景。
样本要求 样品类型: 细胞、组织、基因组DNA。其它类型样品请详询。 样品量: a)细胞 2×107 b)组织 200 mg c)DNA:>=10 µg,溶于无菌水或 TE(PH = 8)(OD 260/280值应在1.7~2.0 之间;RNA 应该去除干净;不得有其它个体或其它物种的DNA污染)。 样品运输及保存: 样品运输:样品置于1.5mL Eppendorf管中,封口膜封好,干冰运输,DNA可用冰袋运输。 样品保存:细胞样品或新鲜组织块切块,液氮冻存后-80℃保存;DNA样品短期内可-20℃,避免反复冻融。云序生物对O8G RNA氧化化检测手段为O8G-IP-Seq技术。
云序优势环状DNA检出率高:采用多种方法高效地富集环状DNA,环状DNA检出率高。专业的生物信息学分析:专业的生物信息学团队,开发了高效识别分析环状DNA的算法,满足客户的各类深入数据分析需求。一站式服务:客户只需提供细胞、组织或基因组DNA,云序生物为您完成从样品准备、环状DNA富集、文库制备、上机测序到数据分析整套服务流程。目前,环状DNA不只可以作为一种新型特异的tumour标志物,还在tumour发生和发展机理研究中发挥着重大的潜在价值。可以预见的是,环状DNA将迅速成为新的科研热点,甚至会对传统遗传学和基因组学带来性影响。m5C环状RNA测序,云序生物为您完成m5C RNA-Seq全套实验服务。重庆云序生物测序
云序生物拥有BD Rhapsody™单细胞免疫组测序平台。黑龙江修饰测序
LC-MS/MS检测核酸修饰水平实验原理:云序生物建立了一种基于LC-MS/MS平台的核酸修饰分析方法,定量4类DNA修饰(5-mdC、5-hmdC、5-fodC、6-mdA)和9类RNA修饰(m5C、m6A、Am、Gm、Cm、Um、m1A、m7G、ac4C),为表观遗传研究提供理想的技术平台。液相色谱串联质谱(LC-MS/MS)能够很好的检测到极性高、稳定性差的化合物,并能够对物质进行精确的定量。LC-MS/MS法是目前所有总体甲基化水平分析方法中能够对含量极低的修饰碱基进行准确定性定量的方法;而将LCMS/MS法与一定的样品前处理方法相结合,能够更好地对各类生物样品中的DNA/RNA修饰进行检测。黑龙江修饰测序
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