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河南农业大学的研究团队利用云序生物提供的环状RNA测序服务,在小麦幼苗叶片中鉴定出大约88个环状RNA分子,而在脱水胁迫幼苗中有62个环状RNA分子存在差异表达。在脱水反应的环状RNA分子中,有6个在小麦中作为26个相应的miRNA的海绵。利用qPCR验证16个环状RNA,包括6个miRNA海绵和10个随机选择的环状RNA, 其中14个环状RNA与测序结果趋势一致,反应测序数据的真实性可靠性。GO分析和KEGG分析揭示circRNAs潜在的生物学功能,例如所涉及的参与脱水反应过程,如光合作用,叶绿素代谢,氧化磷酸化,氨基酸生物合成、代谢以及植物激su信号转导和生长素生物合成等。并且揭示了环状RNA与小麦叶片脱水抗性相关功能基因表达之间关系。m1A RNA甲基化是一类新发现的RNA甲基化,即RNA分子腺嘌呤第1位氮原子上的甲基化修饰。海南m6a环状RNA测序

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作为明星分子,环状RNA的热度与日俱增。环状RNA到底火到了什么程度?从云序客户捷报频传﹑研究成果不断就可见一斑:上期我们刚刚介绍云序客户发表了世界小鼠脑创伤模型外泌体环状RNA的研究,整合了外泌体和环状RNA两大科研热点。在探索新物种的环状RNA研究上,云序客户此前更是先后发表了全世界first斑马鱼环状RNA、first篇小麦环状RNA和first篇鸡环状RNA文章,如今首篇非洲爪蟾的环状RNA文章新鲜出炉了!这一成果今年年初发表在《Chemosphere》(影响因子4.2)上!湖北外泌体环状研究环状RNA可通过RNA介导间接与蛋白质发生关联。

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环状RNA作为一种新发现的非编码RNA,在多种组织及疾病中发挥重要的生物学功能,然而关于其在红斑狼疮性肾炎中的研究鲜有报道。红斑狼疮性肾炎作为一种免疫缺陷性疾病,严重影响了患者的身体健康和生活质量。云序携手中国医科大学周华主任团队在Cell子刊“Molecular Therapy Nucleic Acids”上发表重要研究成果,通过全转录组测序构建了该疾病的环状RNA表达谱,并从313条差异表达结果中挑选感兴趣的环状RNA--CircHLA-C。前期,作者发现miR-150在该疾病中发挥着重要的调控作用,通过生信预测结果显示该环状能够通过竞争性吸附miR-150。

研究背景:利用高通量测序手段,研究者们在拟南芥、小鼠、果蝇和人体内都发现了环状RNA的高度表达,证明了环状RNA在不同物种中存在。目前,已经进行过环状RNA研究的物种数量还非常有限,环状RNA数据库circBase中已收录的物种有7个。作为一种重要的模式生物,非洲爪蟾的环状RNA尚未见报道。本文通过云序生物提供的一站式环状RNA测序、环状RNA定量PCR、环状RNA的RNaseR耐受性实验和生物信息学服务于全世界进行了非洲爪蟾环状RNA表达谱的构建,为后续研究脊椎动物环状RNA的生物学功能奠定了基础,非常具有借鉴意义。环状RNA可直接与蛋白质结合。

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斑马鱼作为一种重要的模式生物,对于其环状RNA的研究还尚未报道。作者以雌雄斑马鱼混合组织为样品,通过云序生物提供的环状RNA测序和生物信息学服务发表了全世界首篇斑马鱼环状RNA表达谱文章。本研究共筛选到3868条环状RNA,为后续研究鱼类环状RNA的生物学功能奠定基础。环状RNA“一站式”服务一直以来是云序生物的主打产品,严格的质控把关、严谨的实验设计、出色的生信分析以及贴心的售后服务造就了多项世界首篇环状RNA研究文章,受到了广大客户的一致好评。上海环状RNA哪家做得好,还是松江区的云序生物比较好。山东m6a环状平台

circRNA 早于20世纪70年代在RNA病毒中被发现。海南m6a环状RNA测序

胶质瘤作为较常见的颅内恶性tumour占颅脑tumour的40%~50%,电磁辐射等其他环境致cancer因素会导致胶质瘤的发生,尽管手术切除、术后放疗、药物化疗等方法可以作为主流的胶质瘤医治手段,但是多形性胶质母细胞瘤(GBM)的强侵袭、增殖能力仍给病人的医治造成很大的困难。上海第二军医大学附属长征医院研究者通过环状RNA测序,从环状RNA角度对胶质瘤的发生和发展进行了研究, 共发现206个上调环状和1205个下调环状,其中扩大样本量qPCR验证(13例正常、68例疾病)后将目标锁定在circBRAF。该环状转录自BRAF基因,虽然在正常人样本当中BRAF基因编码的环状cricBRAF分子mRNA分子水平无明显差异,但是在疾病样本当中circBRAF有明显上调,KM曲线结合临床资料表明该环状的高表达能一定程度上预示着疾病的恶性程度和预后情况。海南m6a环状RNA测序

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