核糖体印迹测序又称Ribosome profiling,或Ribo-seq,是运用测序手段研究翻译组学的一种主要的技术手段。该技术通过使用翻译抑制剂使正在翻译的mRNA序列固定在核糖体上。加入核酸酶处理不受核糖体保护的mRNA,分离核糖体并提取纯化核糖体上未被消化的短片段mRNA(大约30nt),进而获得正在翻译的mRNA序列。这项技术可获得实时全转录组正在翻译的序列信息,使研究者能从分子水平检测蛋白组的翻译情况,并了解蛋白质的翻译水平及翻译过程,在蛋白翻译机制的研究领域中有广阔的应用前景。云序生物率先开展m5C RNA甲基化测序服务。江西测序
目前对m6ARNA流行检测手段为MeRIP-Seq技术,云序生物提供成熟m6ARNA甲基化MeRIP-seq服务,技术原理如下:将甲基化RNA特异性抗体与被随机打断的RNA的片段进行共孵育,抓取有甲基化修饰的片段进行测序;同时需要平行测序一个对照(Input)样本,对照样本只含有打断的RNA的片段,并不添加RNA甲基化特异性抗体与其共孵育。对照样本用于消除非特异性抓取甲基化片段的背景。对比免疫共沉淀(IP)样本和对照样本(Input)中的序列片段,将RNA甲基化修饰位点定位到转录组上,并根据RNA-seq数据,计算样本中RNA甲基化程度。甘肃测序全转录组云序采用多种方法高效地富集环状DNA,环状DNA检出率高。
样本要求样品类型细胞、组织或RNA,其他样本类型请电询。测序样品量1.单碱基测序方式:a)细胞:≥1×108b)组织:500mg-5gc)RNA:100μg-300μg2.MeRIP测序方式:a)细胞:≥2×107b)组织:100mg-1gc)RNA:30μg-300μgd)超微量满足500ng-30μg样品运输及保存样品运输:样品置于1.5mL离心管中,封口膜封好,干冰运输。样品保存:细胞样品或新鲜组织块可用TRIZOL或RNA保护剂处理,液氮冻存后-80℃保存;RNA样品可溶于乙醇或RNA-free的超纯水中,-80℃保存,避免反复冻融。
云序优势环状DNA检出率高:采用多种方法高效地富集环状DNA,环状DNA检出率高。专业的生物信息学分析:专业的生物信息学团队,开发了高效识别分析环状DNA的算法,满足客户的各类深入数据分析需求。一站式服务:客户只需提供细胞、组织或基因组DNA,云序生物为您完成从样品准备、环状DNA富集、文库制备、上机测序到数据分析整套服务流程。目前,环状DNA不只可以作为一种新型特异的tumour标志物,还在tumour发生和发展机理研究中发挥着重大的潜在价值。可以预见的是,环状DNA将迅速成为新的科研热点,甚至会对传统遗传学和基因组学带来性影响。核糖体印迹测序又称Ribosome profiling,或Ribo-seq。
样本要求 样品类型: 细胞、组织、基因组DNA。其它类型样品请详询。 样品量: a)细胞 2×107 b)组织 200 mg c)DNA:>=10 µg,溶于无菌水或 TE(PH = 8)(OD 260/280值应在1.7~2.0 之间;RNA 应该去除干净;不得有其它个体或其它物种的DNA污染)。 样品运输及保存: 样品运输:样品置于1.5mL Eppendorf管中,封口膜封好,干冰运输,DNA可用冰袋运输。 样品保存:细胞样品或新鲜组织块切块,液氮冻存后-80℃保存;DNA样品短期内可-20℃,避免反复冻融。云序生物拥有强大的生信分析团队,可以为客户提供个性化要求。河南测序研究
云序生物acRIP-seq实验采用预验证的商业化抗体和精心优化的实验流程。江西测序
案例3:拟南芥m5CRNA甲基化谱及TRM4B酶对根的影响原文:Transcriptome-WideMappingofRNA5-MethylcytosineinArabidopsismRNAsandNoncodingRNAs期刊:ThePlantCell影响因子:8.23与上篇不同,本研究团队采用m5CRNA甲基化测序研究拟南芥中m5C甲基化谱,在种子,幼芽,根中发现了1000多个特异性的位点。敲低RNAm5C甲基转移酶TRM4B,造成tRNA稳定性的降低。研究人员还证实TRM4B突变体的初级根比野生型更短,同时对氧化的应激反应更敏感。江西测序
上海云序生物科技有限公司在同行业领域中,一直处在一个不断锐意进取,不断制造创新的市场高度,多年以来致力于发展富有创新价值理念的产品标准,在上海市等地区的商务服务中始终保持良好的商业口碑,成绩让我们喜悦,但不会让我们止步,残酷的市场磨炼了我们坚强不屈的意志,和谐温馨的工作环境,富有营养的公司土壤滋养着我们不断开拓创新,勇于进取的无限潜力,云序供携手大家一起走向共同辉煌的未来,回首过去,我们不会因为取得了一点点成绩而沾沾自喜,相反的是面对竞争越来越激烈的市场氛围,我们更要明确自己的不足,做好迎接新挑战的准备,要不畏困难,激流勇进,以一个更崭新的精神面貌迎接大家,共同走向辉煌回来!