云序优势 适用于血清血浆等微量样品: 此法减少DNA损失,并保留原始表达量,不同环状DNA间表达量比较更准确 专业的生物信息学分析: 专业的生物信息学团队,开发了高效识别分析环状DNA的算法,满足客户的各类深入数据分析需求。 一站式服务: 客户只需提供血清血浆,云序生物为您完成从样品准备、环状DNA富集、文库制备、上机测序到数据分析整套服务流程。 样本要求 样品类型: 血清血浆。 样品量: 血清血浆:5mL 样品运输及保存: EDTA抗凝,样品干冰运输。勿用肝素管取样(绿色盖子抗凝管)。专业的生物信息学团队,开发了高效识别分析环状DNA的算法。吉林测序microRNA甲基化
比色法检测整体甲基化水平实验原理 比色法RNA甲基化定量检测试剂盒提供了定量检测总RNA甲基化水平的试剂。采用类似ELISA抑 制竞争免疫的方法,实验样本和RNA甲基化标准品与RNA甲基化抗体共孵育;然后转移到包被有RNA甲基化多核苷酸的条孔上。在孵育之后孔可以洗脱任何未包被的试剂然后添加检测抗体生成信号,通过微孔板读取仪(例:酶标仪)来检测。因为在样本的RNA甲基化抑 制了RNA甲基化抗体与涂抹在孔上RNA甲基化的结合,样本中更高浓度导致与在孔中的RNA甲基化结合减少。因此,从孔中测得信号或OD参数与样本中RNA甲基化的数量成反比。并且样本中RNA甲基化的量可以通过预先设定的RNA甲基化标准品来实现定量检测。重庆平台测序RNA甲基化云序生物acRIP-seq实验采用预验证的商业化抗体和精心优化的实验流程。
近日,Nature杂志上发表了颠覆性研究成果:在tumour中,主要的cancer基因转录本是直接来自于环状DNA的,而环状DNA的染色质是高度开放的,环状DNA的cancer基因能够大量表达,同时缺乏丝粒,导致不遵照孟德尔定律进行遗传,这种特性使得环状DNA是驱动tumour异质性的重要机制。由此可见,由于其结构和表达的特异性,环状DNA可以影响细胞生命活动,促进tumour细胞演进和适应性进化,增加了基因组的可塑性和不稳定性。目前,环状DNA不但可以作为一种新型特异的tumour标志物,还在tumour发生和发展机理研究中发挥着重大的潜在价值。可以预见的是,环状DNA将迅速成为新的科研热点,甚至会对传统遗传学和基因组学带来**性影响。
A&A Bio的环状DNA纯化柱技术简介 研究组织、细胞的环状DNA测序常用Circle-seq技术,Circle-seq测序中就包含柱纯化去除线性DNA,具体步骤是柱纯化去除基因组DNA、外切酶对柱纯化后产物进行酶消化、滚环扩增放大环状DNA信号以及建库测序。因此,相对于大量存在的基因组DNA,环状DNA在细胞中的含量非常少,所以从样品中提取总DNA后,第一步需要通过柱纯化去除基因组DNA,以免测序中基因组DNA占据大部分数据量。柱纯化这一步骤十分关键,既要大限度地去除基因组DNA, 又需很大限度保留环状DNA分子,尤其是避免丢失掉超长和超短的环状DNA。云序生物采用A&A Biotechnology的纯化柱,是绝大部分环状DNA高分文章中所使用的纯化柱,并且云序生物是该品牌在国内的总代理。云序生物专注做测序服务,PCR,质谱检测。
目前对m6A RNA流行检测手段为MeRIP-Seq技术,云序生物提供成熟m6A RNA甲基化MeRIP-seq服务,技术原理如下: 将甲基化RNA特异性抗体与被随机打断的RNA的片段进行共孵育,抓取有甲基化修饰的片段进行测序;同时需要平行测序一个对照(Input)样本,对照样本只含有打断的RNA的片段,并不添加RNA甲基化特异性抗体与其共孵育。对照样本用于消除非特异性抓取甲基化片段的背景。对比免疫共沉淀(IP)样本和对照样本(Input)中的序列片段,将RNA甲基化修饰位点定位到转录组上,并根据RNA-seq数据,计算样本中RNA甲基化程度。在RIP-Seq中,富集峰表示全部活跃转录的区域(相对于对照IgG)。宁夏测序pri-miRNA
测序适用于大多数物种:可以检测几乎任何动植物的环状RNA。吉林测序microRNA甲基化
外显子组测序利用序列富集技术特异性的检测基因组中的外显子区域(编码蛋白的DNA区域),能够直接发现与蛋白质功能变异相关的遗传突变。与全基因组重测序相比,外显子组测序只针对外显子区域,性价比极高,更适用于大样本量疾病及ai症样本分析。外显子捕获试剂盒: 云序生物采用Agilent外显子捕获试剂盒,不仅能检测全部外显子区域,还能检测与蛋白功能密切相关的UTR区域 专业化的生物信息分析: 云序生物具有强大的生物信息学团队,能够满足客户的各类深入数据分析要求吉林测序microRNA甲基化