案例1:小肠腺ai的特异性甲基化组图谱 本文通过MeDIP测序研究了小鼠模型小肠腺ai起始过程中的甲基化变化,发现了13,000多个与小肠腺ai发生相关的差异甲基化区(DMRs)。进一步分析发现:组蛋白修饰复合物PRC2的靶基因在高甲基化DMRs中明显富集,说明组蛋白修饰与DNA甲基化密切相关。此外,在不同类型细胞中,通过重亚硫 酸盐焦磷酸测序证实:这些DMRs是腺ai细胞中全新形成的,而不是通过小肠干细胞或未分化隐窝细胞中已有甲基化模式的扩展形成的。更为有趣的是,作者发现了一些DMRs,它们在小鼠腺ai和人类结肠ai间是保守的,并因此找到了一些在结肠ai中受表观遗传修饰的基因,揭示了甲基化修饰作为临床分子标志物的潜力。云序生物为您完成m5C RNA-Seq全套实验服务。宁夏测序mRNA
环状DNA连登《Nature》《Cell》等高级期刊,彻底颠覆了人们对基因遗传的传统认知,成为了很有潜力的科研新热点。云序生物环状DNA甲基化测序技术基于转座酶和m5C位点酶学转化方法,用核酸外切酶V消化以去除线性DNA。通过转座酶打开环状DNA的环形结构,并在DNA的片段的两端加上接头。通过Klenow酶修复转座产物的末端缺口。通过温和的酶转化法,将未甲基化的胞嘧啶(C)高效地转化为尿嘧啶(U),后续进行文库构建与高通量测序,从而获得发生甲基化修饰的环状DNA。该技术可以同时检测环状DNA和环状DNA的甲基化修饰状态,为环状DNA的深入研究及新型分子标志物的开发提供了新的技术手段。河北分析测序RNA甲基化云序生物拥有受行业认可的BD Rhapsody™单细胞测序平台。
样本要求 样品类型 细胞、组织或RNA,其他样本类型请电询。 测序样品量 1.单碱基测序方式: a) 细胞:≥1×108 b) 组织:500 mg - 5 g c) RNA:100 μg - 300 μg 2. MeRIP测序方式: a) 细胞:≥2×107 b) 组织:100mg - 1g c) RNA:30 μg - 300 μg d) 超微量满足500 ng - 30 μg 样品运输及保存 样品运输:样品置于1.5mL离心管中,封口膜封好,干冰运输。 样品保存:细胞样品或新鲜组织块可用TRIZOL或RNA保护剂处理,液氮冻存后-80℃保存;RNA样品可溶于乙醇或RNA-free的超纯水中,-80℃保存,避免反复冻融。
外泌体(Exosomes)是一种直径在40~100 nm的圆形单层膜结构,是细胞外泌囊泡中体积较小的一种。外泌体可被大多数细胞分泌,并分布于唾液、血浆、乳汁、尿液等体液中。外泌体中不仅包含蛋白质成分,还包括一些RNA成分,如微小RNA ( microRNA,miRNA)、长链非编码RNA和mRNA、环状RNA(circular RNA,circRNA)。外泌体所携带的这些RNA统称为外泌体来源RNA,具有完整的序列结构和生物活性。外泌体中大约含几百种miRNAs,通过外泌体miRNA测序,研究人员可获得与疾病相关的遗传特征(生物标志物),为将来tumour zhi liao领域通过液体活检来寻找有效药 物。云序生物对O8G RNA氧化化检测手段为O8G-IP-Seq技术。
ac4C RNA乙酰化是在RNA ac4C修饰酶的作用下,使N4位乙酰胞嘧啶发生乙酰化的一种保守的化学修饰(N4-acetylcytidine)。早期研究发现该修饰存在于真核生物中丝氨酸及亮氨酸tRNA和18S rRNA上,导致Watson-Crick碱基热稳定性增加,调控蛋白合成中的编码准确性;近期研究发现ac4C分布在人类转录组中,大多数位点出现在编码序列(CDS)内,并且通过改善的mRNA稳定性和翻译促进靶基因表达。目前,ac4C RNA乙酰化修饰作为一类新型RNA修饰,是继m6A修饰之后的又一表观转录组学热点和“超级潜力股”!m7G MeRIP测序方式,采用预验证的商业化抗体和精心优化的实验流程。四川甲基化测序RNA甲基化
云序采用多种方法高效地富集环状DNA,环状DNA检出率高。宁夏测序mRNA
血清血浆环状DNA测序游离于染色体基因组之外的DNA (extrachromosomal DNA,ecDNA)被发现常常以环状的形式存在,这种形式的DNA被称为环状DNA (extrachromosomal circular DNA,eccDNA)。目前也习惯将巨大的环状DNA(>1Mb)称为ecDNA, 而将相对较小的环状DNA称为eccDNA。 传统观点认为真核基因组通常形成稳定的线性染色体。但新的研究表明:无论是在正常体细胞还是cancer细胞中,都存在大量染色体外环状DNA。目前,环状DNA不只可以作为一种新型特异的tumour标志物,还在tumour发生和发展机理研究中发挥着重大的潜在价值。宁夏测序mRNA