样本要求 1)样品类型:细胞、新鲜组织或RNA 样品。 2)样品量: 细胞:2×107 组织:500 mg-1 g RNA:30 - 300 μg,浓度不低于100 ng/μL 3)RNA 质量要求: OD260/280:1.8~2.1 浓度≥ 100 ng/μl RNA 无明显降解(28S:18S ≥ 1.5 或者RIN ≥ 7) 4)样品保存: 新鲜组织可用RNA保护剂处理或液氮冻存后,-80℃保存。 细胞样品,离心收集细胞沉淀后用PBS洗2遍,直接-80℃保存;RNA 样品可溶于乙醇或RNA-free 的超纯水中,-80℃保存。样品保存 Note:样品保存期间避免反复冻融。 5)样品运输:样品置于1.5 ml Eppendorf管或冻存管中,封口膜封好,装在塑料袋中,干冰运输。m6A 修饰就是真核生物 mRNA 中较常见存在的一种修饰形式,得到了常见的关注和研究。ctDNA羟甲基化热点
云序优势 一站式服务: 客户只需提供细胞、组织或RNA,云序生物为您完成从MeRIP富集,文库制备,上机测序到数据分析整套服务流程。 优化的实验流程: MeRIP的富集效率是决定数据质量的关键,云序生物MeRIP实验采用预验证的商业化抗体和精心优化的实验流程,具有极高的效率和特异性。 严格的质控: 云序生物对MeRIP实验的各个关键步骤进行严格的质控,全程监控实验质量,确保客户得到优zhi的数据。 专业的生物信息学分析: 云序生物具有强大的生物信息学团队,能够满足客户的各类深入数据分析需求。 特异性高: 通过抗体特异性富集发生甲基化修饰的RNA的片段,以较低的成本实现转录组范围的RNA甲基化研究。黑龙江甲基化RNA甲基化相关酶在特殊发育时期发挥重要作用。
m6A修饰在植物中是必不可少的。在这里,作者证明了在水稻中表达转基因人RNA去甲基化酶FTO可以使温室条件下的粮食产量增加3倍以上。在田间试验中,转基因FTO在水稻和马铃薯中的表达使产量和生物量增加了约50%。此外,FTO的存在促进了根分生组织细胞增殖和分蘖芽的形成,提高了光合效率和抗旱性,但对成熟细胞大小、茎分生组织细胞增殖、根直径、株高或倍性没有影响。FTO介导了植物RNA中大量的m6A去甲基化(在poly(A) RNA中约7%的去甲基化,在非核糖体核RNA中m6A下降约35%),诱导染色质开放和转录激huo。因此,调控植物RNA m6A甲基化是一种很有前景的策略,可明显提高植物的生长和作物产量。
在这篇文章中,发现番茄果实成熟过程中,mRNA m6A甲基化表现出与DNA甲基化相似的动态变化。RNA甲基组分析表明,m6A甲基化是番茄果实mRNA中普遍存在的修饰,且m6A位点富集于终止密码子周围和3'UTR区。在具有DNA超甲基化的成熟缺陷表观突变体无色非成熟(Cnr)的果实中,有1100多个转录本显示m6A水平升高,而只有134个转录本显示m6A水平降低,表明m6A的整体水平升高。m6A沉积通常与转录本丰度呈负相关。云序优势 一站式服务: 客户只需提供细胞、组织或RNA,云序生物为您完成从MeRIP富集,文库制备,上机测序到数据分析整套服务流程。 RNA甲基化组揭示了m6A介导的DNA去甲基化酶基因SlDML2在番茄果实成熟中的调控作用。
云序特色 √ j较全产品线:可针对性地检测不同类型RNA分子的O8G氧化; √ 特异性高:特异性富集和检测O8G氧化的 RNA的片段; √ 全转录组覆盖:全转录组范围的RNA O8G氧化检测; √ 全物种检测:可以检测几乎任何动植物的O8G氧化; √ 专业化的生信分析:强大的生信团队,专业的O8G氧化数据分析; 产品分类 O8G 全转录组测序:同时检测O8G氧化的环状RNA,LncRNA和mRNA; O8G 环状RNA测序:检测O8G氧化的所有环状RNA; O8G LnRNA测序:同时检测O8G氧化的LncRNA和mRNA; O8G mRNA测序:检测O8G氧化的所有mRNA;m7G RNA甲基化单碱基测序方式,可对m7G甲基化修饰进行单碱基定位。天津环状DNA甲基化
除了拟南芥,在其他植物中如番茄、小麦、玉米以及高粱等均发现了RNA m6A甲基化修饰。ctDNA羟甲基化热点
样品要求 样品类型 细胞、组织或RNA,其他样本类型请电询。 样品量 a)细胞:≥2×107 b)组织:500mg - 1g c) RNA:30μg - 300μg d) 超微量满足500ng - 30μg 样品运输与保存 样品运输:样品置于1.5mL离心管中,封口膜封好,干冰运输。 样品保存:细胞样品或新鲜组织块可用TRIZOL或RNA保护剂处理,液氮冻存后-80℃保存;RNA样品可溶于乙醇或RNA-free的超纯水中,-80℃保存,避免反复冻融。云序优势 一站式服务: 客户只需提供细胞、组织或RNA,云序生物为您完成从MeRIP富集,文库制备,上机测序到数据分析整套服务流程。 ctDNA羟甲基化热点