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RNA修饰是表观遗传学中调控转录后基因表达的关键过程,目前对m6A RNA修饰的研究已进行的如火如荼,而除了m6A以外仍有多种RNA修饰类型参与调控转录后的基因表达,其中包括m1A、m5C、m7G、2’-O-甲基化修饰以及ac4C乙酰化修饰,在这些领域的研究中也不断有高分文章的出现。云序生物是国内RNA修饰测序的ling跑者,可针对mRNA和各种非编码RNA提供各类RNA修饰测序服务 (m6A﹑m1A﹑m5C﹑m7G﹑ac4C﹑2’-O-甲基化等)。m1A RNA甲基化是一类新发现的RNA甲基化,即RNA分子腺嘌呤di1位氮原子上的甲基化修饰(N1-methyladenosine,m1A)。目前对m1A甲基化修饰研究的报道是发表在Molecular Cell上的一篇论文。太原修饰m1A

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m6A是mRNA中普遍存在的一种内部修饰,通过多种机制,比如调控mRNA的剪接、表达、降解、翻译等对mRNA的命运产生不同影响。为了探究m6A修饰在不同组织之间、不同发育阶段的差异,m6A位点在转录本上的位置分布,以及这些分布差异可能对基因调控的进化产生怎样的影响,近期Nucleic Acid Research (IF=11.147)杂志上发表了一篇文章Dynamic landscape and evolution of m6A methylation in human, 通过对9种人类组织的m6A测序,分析了m6A甲基化位点在不同组织中的分布特点、潜在调控机制和进化。海淀区m1AmRNA测序还为进一步m1A甲基化功能验证提供了重要工具。

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案例2:细胞核和线粒体编码的转录本的m1A甲基化修饰,原文:Base-Resolution Mapping Reveals Distinct m1A Methylome in Nuclear- and Mitochondrial-Encoded Transcripts,期刊:Molecular Cell 影响因子:15.59,本研究通过单碱基分辨率方法“m1A-MAP”鉴定了细胞核和线粒体中m1A甲基化修饰位点。结果发现大多数m1A甲基化修饰富集在mRNA的5’UTR,小部分符合“GUUCRA”基序的m1A位点由一个已知的甲基化酶复合物TRMT6/61A修饰。此外,线粒体编码的转录本中也有大量的m1A甲基化修饰。该研究还表明,位于5’UTR区,尤其是转录本di 一和第二位上的m1A可促进mRNA翻译,而位于编码区的m1A可抑 制翻译作用。因此,m1A测序不仅揭示了核编码和线粒体编码的转录本上不同类型的m1A甲基化修饰,还为进一步m1A甲基化功能验证提供了重要工具。

样本要求:样品类型:组织、细胞、体液或RNA样品。其它类型样品请详询。样品量:细胞: > 1×108,组织: > 5 g ,总RNA:> 300 μg (OD260/280≥1.8;OD260/230≥1.5;无明显降解,电泳检测样品特征性条带完整清晰,无明显弥散或拖尾 28S:18S≥1.5或者RIN≥7),样品运输及保存:样品运输:样品置于1.5mL离心管中,封口膜封好,干冰运输。样品保存:细胞样品或新鲜组织块(切成5-10 mg的小块),可用TRIZOL或RNA保护剂处理,液氮冻存后,-80℃保存,RNA样品可溶于乙醇或RNA-free的超纯水中,-80℃保存,样品保存期间避免反复冻融。甲基化测序服务,云序属于很好的企业。

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为了探寻m6A修饰与结直肠ai(CRC)的糖酵解代谢的相关性,采用qPCR检测结直肠ai患者体内脱氧葡萄糖吸收(FDG uptake)和m6A修饰相关酶表达的情况,发现Mettl3(m6A甲基化转移酶)的表达与FDG摄取存在明显的相关性。同时检测到在CRC体内Mettl3高表达和葡萄糖代谢强烈保持一致,那么在结直肠ai患者体内FDG和Mettl3的变化是否影响甲基化整体水平的变化呢?作者采用多种方法检测高FDG CRC和低FDG CRC患者体内甲基化水平,结果表明m6A修饰水平在这些FDG摄取较高的CRC患者中也xian著升高。m1A RNA甲基化是一类新发现的RNA甲基化,即RNA分子腺嘌呤di1位氮原子上的甲基化修饰(N1-methyladenosine,m1A)。RNA甲基化富集峰可视化图。南开区m1A平台

Nature:真核生物mRNA中m1A的动态修饰研究。太原修饰m1A

02 检测整体m1A RNA修饰水平, LC-MS/MS检测整体RNA修饰水平,准确高效,可以实现一次检测,9类修饰水平检测,一步到位。03 m1A RNA修饰上游酶的筛选, m1A RNA修饰相关酶PCR芯片,寻找上游直接调控m1A RNA甲基化的甲基转移酶。04 m1A RNA修饰靶基因验证,meRIP-qPCR,云序提供各类不同修饰的meRIP-qPCR服务,可针对mRNA,lncRNA,环状RNA等不同类型的RNA分子进行检测,低通量验证RNA修饰靶基因表达水平。m1A RNA甲基化是一类新发现的RNA甲基化,即RNA分子腺嘌呤第1位氮原子上的甲基化修饰(N1-methyladenosine,m1A)。太原修饰m1A

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