廊坊m1A环状RNA测序

近日，云序客户分别在肝ai和胃ai中进行了m6A和m5C RNA甲基化的全转录组测序（circRNA、lncRNA和mRNA），其中在肝ai中进行的m5C测序数据发表了三篇表达谱的文章，实现了一次测序，三套数据，三项成果的“大满贯”；随之在胃ai中进行的m6A测序数据也发表两篇表达谱文章。真正体现了一次测序三套数据（circRNA、lncRNA和mRNA），多项成果，超高性价比，短平快发表高分文章。m1A RNA甲基化是一类新发现的RNA甲基化，即RNA分子腺嘌呤di1位氮原子上的甲基化修饰（N1-methyladenosine，m1A）。云序生物为您完成从m1A RNA-seq富集、文库制备、上机测序到数据分析的整套服务流程。廊坊m1A环状RNA测序

01 m1A RNA修饰测序，m1A RNA修饰测序（m1A-seq），对m1A RNA甲基化，目前流行的检测手段为m1A-Seq技术，适用于m1A RNA甲基化谱研究，快速筛选m1A RNA甲基化靶基因。云序可提供mRNA和多种非编码RNA的m1A测序：m1A 全转录组测序（涵盖mRNA，LncRNA，circRNA），m1A  LncRNA测序（涵盖LncRNA和mRNA），m1A  Pri-miRNA测序（涵盖Pri-miRNA和mRNA），m1A  mRNA测序。云序生物是一家比较不错的做RNA甲基化的公司，他们的RNA甲基化口碑很好，m1A RNA甲基化是一类新发现的RNA甲基化，即RNA分子腺嘌呤第1位氮原子上的甲基化修饰（N1-methyladenosine，m1A）。蓟州区遗传m1Am1a环状RNA，云序生物做的比较好，我做了。

m1A RNA甲基化是一类新发现的RNA甲基化，即RNA分子腺嘌呤第1位氮原子上的甲基化修饰（N1-methyladenosine，m1A）。研究表明，m1A是真核生物tRNA和rRNA丰度很高的一种转录后修饰，近期研究也表明m1A修饰可调控mRNA翻译。m1A修饰作为一类新型RNA甲基化，其功能和机制都亟待挖掘。与m6A RNA检测方式一致，针对m1A修饰也采用MeRIP-seq技术，抗体富集的技术原理如下：将m1A RNA甲基化特异性抗体与被随机打断的RNA的片段进行共孵育，抓取有甲基化修饰的片段进行测序；同时需要平行测序一个对照（Input）样本，对照样本为未进行IP反应的RAN片段，对照样本用于消除非特异性抓取甲基化片段的背景。

为了探究m6A保守序列在不同组织之间和发育阶段之间的差异，RRACH保守序列被细分为4种子序列。对比胎儿和成年人的组织，发现心脏、肾和肺组织中m6A保守序列比例发生变化，而肝和肌肉在成年前后m6A保守序列比例相对不变。对比不同组织中的保守序列发现，AAACH和GGACH两种保守序列的比例在组织间差异较大，且同时含有这两种序列的m6A峰的数目明显低于随机重排后分析出的预测数目，暗示了这两种保守序列可能是由不同的甲基化酶亚基互作用蛋白来识别的。m1A-MAP揭示核编码和线粒体编码转录本上不同类型的m1A甲基化组。

案例3：细胞核和线粒体编码的转录本的m1A甲基化修饰-Base-Resolution,期刊：Molecular Cell 影响因子：13.84,本研究通过单碱基分辨率方法的m1A RNA甲基化测序技术鉴定了细胞核和线粒体中m1A 甲基化修饰位点。结果发现大多数m1A甲基化修饰富集在mRNA的5’UTR，小部分符合“GUUCRA”基序的m1A 位点由一个已知的甲基化酶复合物TRMT6/61A 修饰。此外，线粒体编码的转录本中也有大量的m1A 甲基化修饰。该研究还表明，位于5’UTR 区，尤其是转录本di一和第二位上的m1A 可促进mRNA 翻译，而位于编码区的m1A 可抑 制翻译作用。因此，m1A 测序不仅揭示了核编码和线粒体编码的转录本上不同类型的m1A 甲基化修饰，还为进一步m1A 甲基化功能验证提供了重要工具。生物化学表征分析显示：ALKBH1在体外或者细胞内对tRNA中的m1A甲基化都具有去甲基化活性。廊坊m1AmRNA测序

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