张家口m1A研究

01 m1A RNA修饰测序，m1A RNA修饰测序（m1A-seq），对m1A RNA甲基化，目前流行的检测手段为m1A-Seq技术，适用于m1A RNA甲基化谱研究，快速筛选m1A RNA甲基化靶基因。云序可提供mRNA和多种非编码RNA的m1A测序：m1A 全转录组测序（涵盖mRNA，LncRNA，circRNA），m1A  LncRNA测序（涵盖LncRNA和mRNA），m1A  Pri-miRNA测序（涵盖Pri-miRNA和mRNA），m1A  mRNA测序。云序生物是一家比较不错的做RNA甲基化的公司，他们的RNA甲基化口碑很好，m1A RNA甲基化是一类新发现的RNA甲基化，即RNA分子腺嘌呤第1位氮原子上的甲基化修饰（N1-methyladenosine，m1A）。m1A RNA甲基化是一类新发现的RNA甲基化。张家口m1A研究

MeRIP-Seq技术服务由上海云序生物科技有限公司提供，是在已发表实验方法的基础上开发而来，方法简述如下：片段化的RNA与m1A抗体在IPP缓冲液中4度共孵育2小时。反应混合物进一步用protein A磁珠（Thermo Fisher）在4度免疫沉淀2小时。然后用游离的m1A腺苷类似物洗脱磁珠上结合的RNA。洗脱的RNA进一步通过Trizol试剂（Thermo Fisher）进行抽提。抽提纯化的RNA通过RNA建库试剂盒（NEB）建库，并在Illumina Hiseq测序仪上进行双端150bp测序。宝坻区m1AlncRNA测序差异甲基化区的GO和KEGG信号通路分析。

RNA修饰是表观遗传学中调控转录后基因表达的关键过程，目前对m6A RNA甲基化的研究已进行的如火如荼，但除了m6A以外仍有多种热门RNA修饰类型参与调控转录后的基因表达，其中包括m1A、m5C、m7G、2’-O-甲基化修饰以及ac4C乙酰化修饰，在这些领域的研究极具潜力，近期不断有高影响因子文章的出现（如表1）。云序生物是国内RNA修饰测序的先驱，可针对mRNA和各种非编码RNA提供各类RNA修饰测序服务 (m6A﹑m1A﹑m5C﹑m7G﹑ac4C﹑2’-O-甲基化等)。目前，云序已累计支持客户发表25篇高水平文章，合计影响因子171.6分，是国内支持发文较多、累计影响因子较高的公司。

自2010年以来，RNA表观遗传学概念提出后，随后几年这一领域的研究便如火如荼的开展起来，同时也取得了zhuo越的成果，其中包括m6A，m5C RNA甲基化修饰等，而我们要来谈一谈的是近发表在Molecular Cell （IF：14.714）上的一篇关于m1A RNA甲基化的文章，这是一类新型RNA修饰，想必大家也迫不及待地想看看科研研究成果了吧，话不多说，让我们来一探究竟。云序生物是一家比较不错的做RNA甲基化的公司，他们的RNA甲基化口碑很好，m1A RNA甲基化是一类新发现的RNA甲基化，即RNA分子腺嘌呤di1位氮原子上的甲基化修饰（N1-methyladenosine，m1A）。m1A pri-miRNA测序，m1A lncRNA测序，m1A mRNA测序。

此研究由云序生物合作客户华南农业大学余义勋课题组完成的，该课题组利用m1A-seq & RNA-seq（本实验云序提供）技术对矮牵牛花瓣中含m1A修饰的RNA进行全转录组分析，发现乙烯处理降低了花瓣mRNA m1A峰的水平。另外还发现矮牵牛tRNA特异性甲基转移酶61A (PhTRMT61A)的沉默降低了体内和体外mRNA的m1A水平，定位于细胞核内的PhTRMT61A被抑制会导致叶片发育异常。这些研究结果显示RNA m1A修饰可以作为表观转录组调控机制并在植物生长发育中起着重要作用。矮牵牛m1A峰的motif序列和结构特征,矮牵牛m1A峰的motif序列和结构特征,云序生物热门RNA修饰—m5C甲基化。伊成器课题组首先利用高分辨质谱对mRNA中的m1A修饰进行定量，发现其存在于各种细胞系中。张家口m1A研究

云序生物m1A检测技术在业界是相对比较成熟的公司。张家口m1A研究

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