保定m1A全转录组测序

2. m1A-MAP揭示人全转录组m1A修饰,作者通过m1A-MAP在人全转录组水平上进行检测，发现了740个m1A修饰位点，其中473个位点位于mRNA和lncRNA，大部分位于5’-UTR。通过比对SNP数据库，作者还排除了假阳性结果。另外，作者通过多核糖体图谱还发现5’-UTR区域发生m1A与mRNA翻译效率呈正相关，且这种正相关性在cap+1位置上更xian著，但在CDS区域和3’-UTR区都没有出现。这些发现不同位置的m1A修饰可能发挥不同的生物学功能。通过motif分析，作者发现m1A修饰位点偏好GUUCRA序列。另外，作者发现TRMT6/61A不仅是tRNA m1A甲基化酶复合物，也是mRNA上发生m1A修饰所需要的酶。生物在线，丁香通，生物器材，搜狐网均有云序的文章。保定m1A全转录组测序

我们要来谈一谈的是发表在Molecular Cell （IF：14.714）上的一篇关于m1A RNA甲基化的文章，这是一类新型RNA修饰，除了检测核编码转录本外，作者还对线粒体编码的转录本中m1A修饰进行鉴定，也检测到很多m1A甲基化修饰位点，发现在不同的环境刺激下，ND5基因上的m1A修饰水平会发生变化。利用定量蛋白质谱的方法还证实线粒体基因CDS区的m1A会抑制翻译。m1A RNA甲基化是一类新发现的RNA甲基化，即RNA分子腺嘌呤第1位氮原子上的甲基化修饰（N1-methyladenosine，m1A）。海淀区遗传m1ANature突破性研究—RNA甲基化新修饰 m1A。

云序生物RNA修饰高通量测序产品覆盖面广，包括编码mRNA和非编码lncRNA，circRNA，microRNA等分子。云序作为一个成立了数年之久的zi深企业，法人具有业内十余年的经验，全国各地均有专业的销售人员为各大高校，各个医院服务，有针对性的对每个客户的不同需求做出个性化服务，技术团队，数据部门来自国内985，211高校研究生，为客户打造更加jing准高效的数据服务，实验部门更是生物学的高校毕业生，强大的团队是云序成为业界佼佼者的有力支持，未来，云序将会扩充自己强大的主力军，为更多的客户提供更专业的服务。

案例3：细胞核和线粒体编码的转录本的m1A甲基化修饰-Base-Resolution,期刊：Molecular Cell 影响因子：13.84,本研究通过单碱基分辨率方法的m1A RNA甲基化测序技术鉴定了细胞核和线粒体中m1A 甲基化修饰位点。结果发现大多数m1A甲基化修饰富集在mRNA的5’UTR，小部分符合“GUUCRA”基序的m1A 位点由一个已知的甲基化酶复合物TRMT6/61A 修饰。此外，线粒体编码的转录本中也有大量的m1A 甲基化修饰。该研究还表明，位于5’UTR 区，尤其是转录本di一和第二位上的m1A 可促进mRNA 翻译，而位于编码区的m1A 可抑 制翻译作用。因此，m1A 测序不仅揭示了核编码和线粒体编码的转录本上不同类型的m1A 甲基化修饰，还为进一步m1A 甲基化功能验证提供了重要工具。差异甲基化区的GO和KEGG信号通路分析。

m1A修饰作为一类新型RNA甲基化，其功能和机制都亟待挖掘。与m6A RNA检测方式一致，针对m1A修饰也采用MeRIP-seq技术，抗体富集的技术原理如下：将m1A RNA甲基化特异性抗体与被随机打断的RNA的片段进行共孵育，抓取有甲基化修饰的片段进行测序；同时需要平行测序一个对照（Input）样本，对照样本为未进行IP反应的RAN片段，对照样本用于消除非特异性抓取甲基化片段的背景。云序生物作为国内较早做m1A的科研平台，至今用户已发表10+篇m1A相关文章，其中多篇影响因子超过10分，成为国内m1A测序专业的服务平台。云序生物RNA修饰高通量测序产品覆盖面广，包括编码mRNA和非编码lncRNA，circRNA，microRNA等分子。m1A是真核生物tRNA和rRNA丰度很高的一种转录后修饰。保定m1A全转录组测序

目前对m1A甲基化修饰研究的报道是发表在Molecular Cell上的一篇论文。保定m1A全转录组测序

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