ac4C RNA乙酰化甲基化研究

在本研究中，作者对两个玉米(Zeamays)自交系转录组范围内的m6AmRNA分布和多聚体分析进行了平行分析，以评估m6A修饰与翻译状态的整体相关性。m6A位点普遍分布于数千个蛋白编码基因中，局限于一个共识基序内，主要富集于3’UTR区，且m6A修饰在调节替代聚腺苷酸位点的选择中发挥作用。更重要的是，m6A修饰根据其强度和基因位置显示了与翻译状态的多方面相关性。此外，在m6A修饰中观察到大量的种内变异，这种自然变异部分是由基因特异性表达和选择性剪接驱动的。总之，这些发现为鉴定玉米中受m6A修饰的转录本提供了宝贵的资源，并为更好地理解m6A在介导基因表达调控中的自然变异铺平了道路。m6A甲基化主要通过减少IAP mRNA的半衰期而起作用。ac4C RNA乙酰化甲基化研究

样本要求 样品类型 细胞、组织或RNA，其他样本类型请电询。 测序样品量 1.单碱基测序方式： a) 细胞：≥1×108 b) 组织：500 mg - 5 g c) RNA：100 μg - 300 μg 2. MeRIP测序方式： a) 细胞：≥2×107 b) 组织：100mg - 1g c) RNA：30 μg - 300 μg d) 超微量满足500 ng - 30 μg 样品运输及保存 样品运输：样品置于1.5mL离心管中，封口膜封好，干冰运输。 样品保存：细胞样品或新鲜组织块可用TRIZOL或RNA保护剂处理，液氮冻存后-80℃保存；RNA样品可溶于乙醇或RNA-free的超纯水中，-80℃保存，避免反复冻融。江苏miRNA甲基化云序生物率先开展m5C RNA甲基化测序服务，采用经典重亚硫 酸盐处理的方式进行测序。

案例3：拟南芥m5C RNA甲基化谱及TRM4B酶对根的影响 原文：Transcriptome-Wide Mapping of RNA 5-Methylcytosine in Arabidopsis mRNAs and Noncoding RNAs 期刊：The Plant Cell 影响因子：8.23 与上篇不同，本研究团队采用m5C RNA甲基化测序研究拟南芥中m5C甲基化谱，在种子，幼芽，根中发现了1000多个特异性的位点。敲低RNA m5C甲基转移酶TRM4B，造成tRNA稳定性的降低。研究人员还证实TRM4B突变体的初级根比野生型更短，同时对氧化的应激反应更敏感。

云序特色 √ j较全产品线：可针对性地检测不同类型RNA分子的O8G氧化； √ 特异性高：特异性富集和检测O8G氧化的 RNA的片段； √ 全转录组覆盖：全转录组范围的RNA O8G氧化检测； √ 全物种检测：可以检测几乎任何动植物的O8G氧化； √ 专业化的生信分析：强大的生信团队，专业的O8G氧化数据分析； 产品分类 O8G 全转录组测序：同时检测O8G氧化的环状RNA，LncRNA和mRNA； O8G 环状RNA测序：检测O8G氧化的所有环状RNA； O8G LnRNA测序：同时检测O8G氧化的LncRNA和mRNA； O8G mRNA测序：检测O8G氧化的所有mRNA；m7G RNA甲基化修饰作为一类新型RNA甲基化。

云序生物对O8G RNA氧化化检测手段为O8G-IP-Seq技术，技术原理如下： 将O8G特异性抗体与被随机打断的RNA的片段进行共孵育，抓取有O8G修饰的片段进行测序；同时需要平行测序一个对照（Input）样本，对照样本只含有打断的RNA的片段，并不添加O8G特异性抗体与其共孵育。对照样本用于消除非特异性抓取的O8G片段的背景。对比免疫共沉淀（IP）样本和对照样本（Input）中的序列片段，将O8G氧化修饰位点定位到转录组上，并根据RNA-seq数据，计算样本中O8G氧化程度及对RNA表达水平的影响。科学家们发现了一种可逆的RNA甲基化—m6A。北京甲基化表达

包括：mRNA 5’帽子结构、mRNA内部、pri-miRNA、转运RNA（tRNA）和核糖体RNA（rRNA）。ac4C RNA乙酰化甲基化研究

mRNA m6Am-Exo-seq 测序服务 云序生物在国内首批引入 m6Am-Exo-seq 测序服务，利用 5’ 核酸外切酶消除非目的性的 RNA的片段上 m6A 修饰的信号干扰，选择性地获取 mRNA 5’ 帽子结构下游 m6Am 修饰富集区域的序列信息。对选择性获取到的 m6Am 修饰的 RNA的 片段进行反转录建库和高通量测序，可为后续的生物信息学分析提供丰富的数据，进而揭示差异性 m6Am 修饰位点的特征及其可能的生物学功能，为您的科研课题提供强劲的助力。 云序优势 一站式服务： 客户只需提供细胞、组织或RNA，云序生物为您完成从MeRIP富集，文库制备，上机测序到数据分析整套服务流程。 ac4C RNA乙酰化甲基化研究