m1ARNA甲基化是一类新发现的RNA甲基化,即RNA分子腺嘌呤第1位氮原子上的甲基化修饰。研究表明,m1A是真核生物tRNA和rRNA丰度很高的一种转录后修饰,近期研究也表明m1A修饰可调控mRNA翻译。m1A修饰作为一类新型RNA甲基化,其功能和机制都亟待挖掘。与m6ARNA检测方式一致,针对m1A修饰也采用MeRIP-seq技术,抗体富集的技术原理如下:将m1ARNA甲基化特异性抗体与被随机打断的RNA的片段进行共孵育,抓取有甲基化修饰的片段进行测序;同时需要平行测序一个对照(Input)样本,对照样本为未进行IP反应的RAN片段,对照样本用于消除非特异性抓取甲基化片段的背景。近期研究也表明m1A修饰可调控mRNA翻译。西青区分析m1A
研究表明,m1A 是真核生物 tRNA 和 rRNA 丰度很高的一种转录后修饰,近期研究也表明 m1A 修饰可调控 mRNA 翻译。m1A 修饰作为一类新型 RNA 甲基化,其功能和机制都亟待挖掘。云序生物作为m1A RNA甲基化研究的先驱者,能够为客户提供专业和优zhi的m1A RNA甲基化测序服务。我们承接上期的m5C RNA甲基化,为大家带来m1A RNA甲基化研究进展。云序生物是一家比较不错的做RNA甲基化的公司,他们的RNA甲基化口碑很好,m1A RNA甲基化是一类新发现的RNA甲基化,即RNA分子腺嘌呤第1位氮原子上的甲基化修饰(N1-methyladenosine,m1A)。蓟州区遗传m1A上海云序生物,一家专业做测序,试剂盒的良心企业。
为了探究m6A保守序列在不同组织之间和发育阶段之间的差异,RRACH保守序列被细分为4种子序列。对比胎儿和成年人的组织,发现心脏、肾和肺组织中m6A保守序列比例发生变化,而肝和肌肉在成年前后m6A保守序列比例相对不变。对比不同组织中的保守序列发现,AAACH和GGACH两种保守序列的比例在组织间差异较大,且同时含有这两种序列的m6A峰的数目明显低于随机重排后分析出的预测数目,暗示了这两种保守序列可能是由不同的甲基化酶亚基互作用蛋白来识别的。云序生物是一家比较不错的做RNA甲基化的公司,他们的RNA甲基化口碑很好,
Molecular Cancer (IF=10.679)杂志刊登了m6A修饰研究:m6A依赖的糖酵解增强结直肠ai(CRC)发生。该文章采用多组学联合应用技术检测了Mettl3-KO(m6A甲基化转移酶敲除细胞株)和WT HCT116(结直肠ai细胞株)甲基化修饰,这项研究揭示METTL3通过m6A-IGF2BP2/3-依赖性机制稳定HK2和SLC2A1 (GLUT1)在CRC中表达,表明m6A修饰的糖酵解途径可以促进结直肠ai的发展,同时为以METTL3及其途径为靶点高糖代谢的CRC患者提供了合理的zhi疗靶点和zhi疗方向。m1A RNA甲基化是一类新发现的RNA甲基化,即RNA分子腺嘌呤di1位氮原子上的甲基化修饰(N1-methyladenosine,m1A)。Molecular Cell:细胞核和线粒体编码的转录本的m1A甲基化修饰:Base-Resolution。
1. m1A-MAP技术及其在tRNA中的验证,利用m1A会导致错配的特性,采用去甲基化酶AlkB来实现m1A去甲基化,对比(-)去甲基化酶和(+)去甲基化酶的结果,捕捉碱基突变的信号,来实现m1A RNA修饰位点单碱基分辨率的鉴定,为了增加检测灵敏度,作者还利用抗体富集的方式来特异性富集m1A的RNA的片段,作者将这个方法命名为m1A-MAP。在哺乳动物中,已知tRNA第9,14和58位会发生m1A RNA修饰,通过这个技术,细胞质中tRNAAsp(GUC)第9位及tRNA第58位都被检测到m1A RNA修饰,以上结果都证实该方法确实可有效单碱基分辨率的鉴定m1A RNA修饰位点。生物化学表征分析显示:ALKBH1在体外或者细胞内对tRNA中的m1A甲基化都具有去甲基化活性。津南区修饰m1A
RNA甲基化富集峰可视化图。西青区分析m1A
为了探究m6A保守序列在不同组织之间和发育阶段之间的差异,RRACH保守序列被细分为4种子序列。对比胎儿和成年人的组织,发现心脏、肾和肺组织中m6A保守序列比例发生变化,而肝和肌肉在成年前后m6A保守序列比例相对不变。对比不同组织中的保守序列发现,AAACH和GGACH两种保守序列的比例在组织间差异较大,且同时含有这两种序列的m6A峰的数目明显低于随机重排后分析出的预测数目,暗示了这两种保守序列可能是由不同的甲基化酶亚基互作用蛋白来识别的。西青区分析m1A