1. m1A-MAP技术及其在tRNA中的验证,利用m1A会导致错配的特性,采用去甲基化酶AlkB来实现m1A去甲基化,对比(-)去甲基化酶和(+)去甲基化酶的结果,捕捉碱基突变的信号,来实现m1A RNA修饰位点单碱基分辨率的鉴定,为了增加检测灵敏度,作者还利用抗体富集的方式来特异性富集m1A的RNA的片段,作者将这个方法命名为m1A-MAP。在哺乳动物中,已知tRNA第9,14和58位会发生m1A RNA修饰,通过这个技术,细胞质中tRNAAsp(GUC)第9位及tRNA第58位都被检测到m1A RNA修饰,以上结果都证实该方法确实可有效单碱基分辨率的鉴定m1A RNA修饰位点。云序客户|华南农业大学余义勋课题组揭示植物RNA m1A修饰调控机制。密云区上海云序生物m1A
样本要求:样品类型:组织、细胞、体液或RNA样品。其它类型样品请详询。样品量:细胞: > 1×108,组织: > 5 g ,总RNA:> 300 μg (OD260/280≥1.8;OD260/230≥1.5;无明显降解,电泳检测样品特征性条带完整清晰,无明显弥散或拖尾 28S:18S≥1.5或者RIN≥7),样品运输及保存:样品运输:样品置于1.5mL离心管中,封口膜封好,干冰运输。样品保存:细胞样品或新鲜组织块(切成5-10 mg的小块),可用TRIZOL或RNA保护剂处理,液氮冻存后,-80℃保存,RNA样品可溶于乙醇或RNA-free的超纯水中,-80℃保存,样品保存期间避免反复冻融。河北区遗传m1Am1A修饰作为一类新型RNA甲基化,其功能和机制都亟待挖掘。
m6A是mRNA中普遍存在的一种内部修饰,通过多种机制,比如调控mRNA的剪接、表达、降解、翻译等对mRNA的命运产生不同影响。为了探究m6A修饰在不同组织之间、不同发育阶段的差异,m6A位点在转录本上的位置分布,以及这些分布差异可能对基因调控的进化产生怎样的影响,近期Nucleic Acid Research (IF=11.147)杂志上发表了一篇文章Dynamic landscape and evolution of m6A methylation in human, 通过对9种人类组织的m6A测序,分析了m6A甲基化位点在不同组织中的分布特点、潜在调控机制和进化。
为了研究人细胞转录组中的m1A修饰,伊成器课题组首先利用高分辨质谱对mRNA中的m1A修饰进行定量,发现其guang泛存在于各种细胞系中。该研究继而通过化学生物学、高通量测序等手段,发展了“m1A-ID-seq” 一种结合抗体富集和特异性酶促反应的m1A RNA甲基化测序新技术。利用这一技术,该研究成功实现了人细胞系全转录组水平的高分辨率m1A检测,鉴定出901个含有m1A修饰的转录本,并且发现m1A呈现强烈的5’非转录区分布特异性。云序生物是一家比较不错的做RNA甲基化的公司,他们的RNA甲基化口碑很好,Molecular Cell:细胞核和线粒体编码的转录本的m1A甲基化修饰:Base-Resolution。
案例1:真核生物mRNA中m1A的动态修饰研究,原文:The dynamic N1-methyladenosine methylome in eukaryotic messenger RNA,期刊:Nature 影响因子:41.456,芝加哥大学等处的科学家在国际杂志Nature上发表的一项研究论文,该研究通过m1A RNA甲基化测序技术在真核生物mRNA中对m1A甲基化作用进行细致的分析,揭示了m1A修饰可以明显增强基因向蛋白质的表达过程。并且m1A修饰具有进化保守性,在人类、啮齿类动物及酵母中普遍存在。m1A RNA甲基化是一类新发现的RNA甲基化,即RNA分子腺嘌呤第1位氮原子上的甲基化修饰(N1-methyladenosine,m1A)。云序技术优势,可单碱基分辨率检测m1A甲基化修饰。石家庄m1A价格
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RNA修饰是表观遗传学中调控转录后基因表达的关键过程,目前对m6A RNA修饰的研究已进行的如火如荼,而除了m6A以外仍有多种RNA修饰类型参与调控转录后的基因表达,其中包括m1A、m5C、m7G、2’-O-甲基化修饰以及ac4C乙酰化修饰,在这些领域的研究中也不断有高分文章的出现。云序生物是国内RNA修饰测序的ling跑者,可针对mRNA和各种非编码RNA提供各类RNA修饰测序服务 (m6A﹑m1A﹑m5C﹑m7G﹑ac4C﹑2’-O-甲基化等)。m1A RNA甲基化是一类新发现的RNA甲基化,即RNA分子腺嘌呤di1位氮原子上的甲基化修饰(N1-methyladenosine,m1A)。密云区上海云序生物m1A