这一分布规律与m6A(真核细胞mRNA中广fan的甲基化修饰)截然不同,后者主要集中在mRNA的靠后一个外显子上,并且对mRNA的翻译、定位、稳定性等多个过程进行调控。该研究进一步鉴定了m1A修饰的一个去甲基化酶ALKBH3,并发现了转录组中ALKBH3的近千个作用位点。因此,该研究不但揭示了m1A的广fan存在、绘制了转录组中m1A RNA修饰的谱图,也为m1A修饰参与基因表达调控的研究提供了重要工具。云序生物是一家比较不错的做RNA甲基化的公司,他们的RNA甲基化口碑很好,云序生物为您完成从m1A RNA-seq富集、文库制备、上机测序到数据分析的整套服务流程。太原m1AlncRNA测序
此研究由云序生物合作客户华南农业大学余义勋课题组完成的,该课题组利用m1A-seq & RNA-seq(本实验云序提供)技术对矮牵牛花瓣中含m1A修饰的RNA进行全转录组分析,发现乙烯处理降低了花瓣mRNA m1A峰的水平。另外还发现矮牵牛tRNA特异性甲基转移酶61A (PhTRMT61A)的沉默降低了体内和体外mRNA的m1A水平,定位于细胞核内的PhTRMT61A被抑制会导致叶片发育异常。这些研究结果显示RNA m1A修饰可以作为表观转录组调控机制并在植物生长发育中起着重要作用。矮牵牛m1A峰的motif序列和结构特征,矮牵牛m1A峰的motif序列和结构特征,云序生物热门RNA修饰—m5C甲基化。朝阳区m1A测序云序生物m1A检测技术在业界是相对比较成熟的公司。
生物化学表征分析显示:ALKBH1在体外或者细胞内对tRNA中的m1A甲基化都具有去甲基化活性。同时展示了ALKBH1控制tRNA iMet以影响翻译起始,并且m1A甲基化的tRNA优先被招募到多核糖体以促进翻译伸长。ALKBH1介导的tRNA去甲基化控制在翻译中具靶标的效用翻tRNAs,从而直接影响蛋白质的合成。这个过程是动态的,并被人类细胞用于对葡萄糖剥夺作出反应。这一发现打开了一个潜在的可逆tRNA甲基化影响基因表达的新范式。云序生物是一家比较不错的做RNA甲基化的公司,他们的RNA甲基化口碑很好,
m1A RNA甲基化是一类新发现的RNA甲基化,即RNA分子腺嘌呤第1位氮原子上的甲基化修饰(N1-methyladenosine,m1A)。研究表明,m1A是真核生物tRNA和rRNA丰度很高的一种转录后修饰,近期研究也表明m1A修饰可调控mRNA翻译。m1A修饰作为一类新型RNA甲基化,其功能和机制都亟待挖掘。与m6A RNA检测方式一致,针对m1A修饰也采用MeRIP-seq技术,抗体富集的技术原理如下:将m1A RNA甲基化特异性抗体与被随机打断的RNA的片段进行共孵育,抓取有甲基化修饰的片段进行测序;同时需要平行测序一个对照(Input)样本,对照样本为未进行IP反应的RAN片段,对照样本用于消除非特异性抓取甲基化片段的背景。云序客户|华南农业大学余义勋课题组揭示植物RNA m1A修饰调控机制。
案例2:细胞核和线粒体编码的转录本的m1A甲基化修饰,原文:Base-Resolution Mapping Reveals Distinct m1A Methylome in Nuclear- and Mitochondrial-Encoded Transcripts,期刊:Molecular Cell 影响因子:15.59,本研究通过单碱基分辨率方法“m1A-MAP”鉴定了细胞核和线粒体中m1A甲基化修饰位点。结果发现大多数m1A甲基化修饰富集在mRNA的5’UTR,小部分符合“GUUCRA”基序的m1A位点由一个已知的甲基化酶复合物TRMT6/61A修饰。此外,线粒体编码的转录本中也有大量的m1A甲基化修饰。该研究还表明,位于5’UTR区,尤其是转录本di 一和第二位上的m1A可促进mRNA翻译,而位于编码区的m1A可抑 制翻译作用。因此,m1A测序不仅揭示了核编码和线粒体编码的转录本上不同类型的m1A甲基化修饰,还为进一步m1A甲基化功能验证提供了重要工具。m1a全转录组测序,上海云序生物更专业。延庆区云序生物m1A
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m6A是mRNA中普遍存在的一种内部修饰,通过多种机制,比如调控mRNA的剪接、表达、降解、翻译等对mRNA的命运产生不同影响。为了探究m6A修饰在不同组织之间、不同发育阶段的差异,m6A位点在转录本上的位置分布,以及这些分布差异可能对基因调控的进化产生怎样的影响,近期Nucleic Acid Research (IF=11.147)杂志上发表了一篇文章Dynamic landscape and evolution of m6A methylation in human, 通过对9种人类组织的m6A测序,分析了m6A甲基化位点在不同组织中的分布特点、潜在调控机制和进化。太原m1AlncRNA测序