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m1A RNA甲基化是一类新发现的RNA甲基化,即RNA分子腺嘌呤第1位氮原子上的甲基化修饰(N1-methyladenosine,m1A)。研究表明,m1A是真核生物tRNA和rRNA丰度很高的一种转录后修饰,近期研究也表明m1A修饰可调控mRNA翻译。m1A修饰作为一类新型RNA甲基化,其功能和机制都亟待挖掘。与m6A RNA检测方式一致,针对m1A修饰也采用MeRIP-seq技术,抗体富集的技术原理如下:将m1A RNA甲基化特异性抗体与被随机打断的RNA的片段进行共孵育,抓取有甲基化修饰的片段进行测序;同时需要平行测序一个对照(Input)样本,对照样本为未进行IP反应的RAN片段,对照样本用于消除非特异性抓取甲基化片段的背景。云序生物m1A检测技术在业界是相对比较成熟的公司。大兴区m1A全转录组测序

大兴区m1A全转录组测序,m1A

为了研究人细胞转录组中的m1A修饰,伊成器课题组首先利用高分辨质谱对mRNA中的m1A修饰进行定量,发现其guang泛存在于各种细胞系中。该研究继而通过化学生物学、高通量测序等手段,发展了“m1A-ID-seq” 一种结合抗体富集和特异性酶促反应的m1A RNA甲基化测序新技术。利用这一技术,该研究成功实现了人细胞系全转录组水平的高分辨率m1A检测,鉴定出901个含有m1A修饰的转录本,并且发现m1A呈现强烈的5’非转录区分布特异性。云序生物是一家比较不错的做RNA甲基化的公司,他们的RNA甲基化口碑很好,唐山云序生物m1Am1A是真核生物tRNA和rRNA丰度很高的一种转录后修饰。

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目前对m1A甲基化修饰研究的报道是发表在Molecular Cell上的一篇论文。该研究通过单碱基分辨率方法“m1A RNA甲基化测序”鉴定了细胞核和线粒体中 m1A 甲基化修饰位点。结果发现大多数 m1A 甲基化修饰富集在 mRNA的 5’UTR,小部分符合“GUUCRA”基序的 m1A 位点由一个已知的甲基化酶复合物TRMT6/61A 修饰。此外,线粒体编码的转录本中也有大量的 m1A 甲基化修饰。云序生物是一家比较不错的做RNA甲基化的公司,他们的RNA甲基化口碑很好,m1A RNA甲基化是一类新发现的RNA甲基化,即RNA分子腺嘌呤第1位氮原子上的甲基化修饰(N1-methyladenosine,m1A)。

RNA修饰是表观遗传学中调控转录后基因表达的关键过程,目前对m6A RNA甲基化的研究已进行的如火如荼,但除了m6A以外仍有多种热门RNA修饰类型参与调控转录后的基因表达,其中包括m1A、m5C、m7G、2’-O-甲基化修饰以及ac4C乙酰化修饰,在这些领域的研究极具潜力,近期不断有高影响因子文章的出现(如表1)。云序生物是国内RNA修饰测序的先驱,可针对mRNA和各种非编码RNA提供各类RNA修饰测序服务 (m6A﹑m1A﹑m5C﹑m7G﹑ac4C﹑2’-O-甲基化等)。目前,云序已累计支持客户发表25篇高水平文章,合计影响因子171.6分,是国内支持发文较多、累计影响因子较高的公司。今年9月份,何川教授团队在Nature Methods发布了m1A甲基化修饰。

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云序生物作为国内很早做m6A的科研平台,至今用户已发表15+篇m6A相关文章,其中多篇影响因子超过10分,成为国内m6A测序专业的服务平台。云序生物RNA修饰高通量测序产品覆盖面广,包括编码mRNA和非编码lncRNA,circRNA,microRNA等分子。云序生物既提供针对单个分子的m6A测序,也提供一次检测多种RNA分子m6A修饰的全转录组测序,此外公司长期致力于提供you质前沿表观研究测序产品,结合科研热点继m6A、m5C、m1A之后,隆重推出多款RNA新修饰,不仅有m7G测序,还包括m3C测序、ac4C乙酰化测序和2'-O-甲基化测序,打造了全修饰和全分子覆盖的研究平台。如今云序用户m6A,m5C、m1A文章接连发表,期待云序用户其他RNA修饰研究的发表!还为进一步m1A甲基化功能验证提供了重要工具。昌平区平台m1A

全转录组水平测序揭示可逆与动态的m1A RNA修饰。大兴区m1A全转录组测序

为了探寻m6A修饰与结直肠ai(CRC)的糖酵解代谢的相关性,采用qPCR检测结直肠ai患者体内脱氧葡萄糖吸收(FDG uptake)和m6A修饰相关酶表达的情况,发现Mettl3(m6A甲基化转移酶)的表达与FDG摄取存在明显的相关性。同时检测到在CRC体内Mettl3高表达和葡萄糖代谢强烈保持一致,那么在结直肠ai患者体内FDG和Mettl3的变化是否影响甲基化整体水平的变化呢?作者采用多种方法检测高FDG CRC和低FDG CRC患者体内甲基化水平,结果表明m6A修饰水平在这些FDG摄取较高的CRC患者中也xian著升高。m1A RNA甲基化是一类新发现的RNA甲基化,即RNA分子腺嘌呤di1位氮原子上的甲基化修饰(N1-methyladenosine,m1A)。大兴区m1A全转录组测序

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