m6A是mRNA中普遍存在的一种内部修饰,通过多种机制,比如调控mRNA的剪接、表达、降解、翻译等对mRNA的命运产生不同影响。为了探究m6A修饰在不同组织之间、不同发育阶段的差异,m6A位点在转录本上的位置分布,以及这些分布差异可能对基因调控的进化产生怎样的影响,近期Nucleic Acid Research (IF=11.147)杂志上发表了一篇文章Dynamic landscape and evolution of m6A methylation in human, 通过对9种人类组织的m6A测序,分析了m6A甲基化位点在不同组织中的分布特点、潜在调控机制和进化。上海云序生物,一家专业做测序,试剂盒的良心企业。东丽区m1A全转录组测序
样本要求:样品类型:组织、细胞、体液或RNA样品。其它类型样品请详询。样品量:细胞: > 1×108,组织: > 5 g ,总RNA:> 300 μg (OD260/280≥1.8;OD260/230≥1.5;无明显降解,电泳检测样品特征性条带完整清晰,无明显弥散或拖尾 28S:18S≥1.5或者RIN≥7),样品运输及保存:样品运输:样品置于1.5mL离心管中,封口膜封好,干冰运输。样品保存:细胞样品或新鲜组织块(切成5-10 mg的小块),可用TRIZOL或RNA保护剂处理,液氮冻存后,-80℃保存,RNA样品可溶于乙醇或RNA-free的超纯水中,-80℃保存,样品保存期间避免反复冻融。东城区上海云序生物m1ARNA甲基化富集峰可视化图。
此研究由云序生物合作客户华南农业大学余义勋课题组完成的,该课题组利用m1A-seq & RNA-seq(本实验云序提供)技术对矮牵牛花瓣中含m1A修饰的RNA进行全转录组分析,发现乙烯处理降低了花瓣mRNA m1A峰的水平。另外还发现矮牵牛tRNA特异性甲基转移酶61A (PhTRMT61A)的沉默降低了体内和体外mRNA的m1A水平,定位于细胞核内的PhTRMT61A被抑制会导致叶片发育异常。这些研究结果显示RNA m1A修饰可以作为表观转录组调控机制并在植物生长发育中起着重要作用。矮牵牛m1A峰的motif序列和结构特征,矮牵牛m1A峰的motif序列和结构特征,云序生物热门RNA修饰—m5C甲基化。
何川教授助力m1A甲基化修饰研究。2019年9月23日,美国芝加哥大学Bryan C. Dickinson团队与何川团队在Nature Methods上发表“Evolution of a reverse transcriptase to map N1-methyladenosine in humanmessenger RNA”研究成果,该项研究开发并验证了一个逆转录酶进化平台,可快速选择逆转录酶,使其在逆转录过程中越过RNA修饰位点,并使其发生突变,从而特异性识别RNA修饰。该平台首先被应用到了对m1A修饰的检测,在测序过程中产生突变标记,终实现单碱基识别m1A,为m1A生物学的研究提供了新的工具、分析方法和数据集。全国各地均有销售在线,请在官网留言咨询。
为了探究m6A保守序列在不同组织之间和发育阶段之间的差异,RRACH保守序列被细分为4种子序列。对比胎儿和成年人的组织,发现心脏、肾和肺组织中m6A保守序列比例发生变化,而肝和肌肉在成年前后m6A保守序列比例相对不变。对比不同组织中的保守序列发现,AAACH和GGACH两种保守序列的比例在组织间差异较大,且同时含有这两种序列的m6A峰的数目明显低于随机重排后分析出的预测数目,暗示了这两种保守序列可能是由不同的甲基化酶亚基互作用蛋白来识别的。云序生物是一家比较不错的做RNA甲基化的公司,他们的RNA甲基化口碑很好,Nature:真核生物mRNA中m1A的动态修饰研究。津南区m1A环状RNA测序
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该研究还表明,位于 5’UTR 区,尤其是转录本di一和第二位上的 m1A 可促进 mRNA 翻译,而位于编码区的 m1A 可抑制翻译作用。因此,m1A 测序不仅揭示了核编码和线粒体编码的转录本上不同类型的 m1A 甲基化修饰,还为进一步 m1A 甲基化功能验证提供了重要工具。m1A 修饰作为一类新型 RNA 甲基化,其功能和机制都亟待挖掘。云序生物作为m1A RNA甲基化研究的先驱者,能够为客户提供专业和优zhi的m1A RNA甲基化测序服务。云序生物是一家比较不错的做RNA甲基化的公司,他们的RNA甲基化口碑很好,东丽区m1A全转录组测序