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在m1A领域,云序生物是国内一家有文献发表的测序服务平台。2020年8月,云序客户在Plant physiology发表了矮牵牛m1A甲基化修饰文章,其中的m1A测序和相关数据分析均由云序提供。这个新领域的研究进展如何?有哪些新型的方法思路值得我们借鉴呢?小编汇集了近期多篇m1A修饰文章,带大家把握这一领域的前沿进展。1.m1A——矮牵牛mRNA中m1A修饰的动态变化(云序客户文章),2.对不同RNA修饰调控作用的新见解:重新定义转录和翻译之间的桥梁,3.m1A——寡核苷酸质谱法guang泛的应用于体外分析甲基化酶和去甲基化酶。目前对m1A甲基化修饰研究的报道是发表在Molecular Cell上的一篇论文。北辰区m1A研究

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该研究还表明,位于 5’UTR 区,尤其是转录本di一和第二位上的 m1A 可促进 mRNA 翻译,而位于编码区的 m1A 可抑制翻译作用。因此,m1A 测序不仅揭示了核编码和线粒体编码的转录本上不同类型的 m1A 甲基化修饰,还为进一步 m1A 甲基化功能验证提供了重要工具。m1A 修饰作为一类新型 RNA 甲基化,其功能和机制都亟待挖掘。云序生物作为m1A RNA甲基化研究的先驱者,能够为客户提供专业和优zhi的m1A RNA甲基化测序服务。云序生物是一家比较不错的做RNA甲基化的公司,他们的RNA甲基化口碑很好,密云区m1A平台生物在线,丁香通,生物器材,搜狐网均有云序的文章。

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MeRIP-Seq技术服务由上海云序生物科技有限公司提供,是在已发表实验方法的基础上开发而来,方法简述如下:片段化的RNA与m1A抗体在IPP缓冲液中4度共孵育2小时。反应混合物进一步用protein A磁珠(Thermo Fisher)在4度免疫沉淀2小时。然后用游离的m1A腺苷类似物洗脱磁珠上结合的RNA。洗脱的RNA进一步通过Trizol试剂(Thermo Fisher)进行抽提。抽提纯化的RNA通过RNA建库试剂盒(NEB)建库,并在Illumina Hiseq测序仪上进行双端150bp测序。

m1ARNA甲基化是一类新发现的RNA甲基化,即RNA分子腺嘌呤第1位氮原子上的甲基化修饰。研究表明,m1A是真核生物tRNA和rRNA丰度很高的一种转录后修饰,近期研究也表明m1A修饰可调控mRNA翻译。m1A修饰作为一类新型RNA甲基化,其功能和机制都亟待挖掘。与m6ARNA检测方式一致,针对m1A修饰也采用MeRIP-seq技术,抗体富集的技术原理如下:将m1ARNA甲基化特异性抗体与被随机打断的RNA的片段进行共孵育,抓取有甲基化修饰的片段进行测序;同时需要平行测序一个对照(Input)样本,对照样本为未进行IP反应的RAN片段,对照样本用于消除非特异性抓取甲基化片段的背景。四川,云南,重庆,香港,江西,浙江。

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为了研究人细胞转录组中的m1A修饰,伊成器课题组首先利用高分辨质谱对mRNA中的m1A修饰进行定量,发现其guang泛存在于各种细胞系中。该研究继而通过化学生物学、高通量测序等手段,发展了“m1A-ID-seq” 一种结合抗体富集和特异性酶促反应的m1A RNA甲基化测序新技术。利用这一技术,该研究成功实现了人细胞系全转录组水平的高分辨率m1A检测,鉴定出901个含有m1A修饰的转录本,并且发现m1A呈现强烈的5’非转录区分布特异性。云序生物是一家比较不错的做RNA甲基化的公司,他们的RNA甲基化口碑很好,云序生物m1A检测技术在业界是相对比较成熟的公司。丰台区m1A测序

差异甲基化区的GO和KEGG信号通路分析。北辰区m1A研究

云序生物提供比色法检测整体m6A修饰水平、RNA修饰测序、MeRIP-qPCR验证、RIP和RNA pull-down机制等研究服务。2016年至今,检测样本数量累积超过5000+,MeRIP富集成功率高达98%以上。为解决客户样本量少的问题,云序早已经推出超微量MeRIP测序技术,500ng总RNA即可完成测序。特殊样本如血清,血浆,外泌体和石蜡等也可进行RNA修饰测序。m1A RNA甲基化是一类新发现的RNA甲基化,即RNA分子腺嘌呤第1位氮原子上的甲基化修饰(N1-methyladenosine,m1A)。北辰区m1A研究

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