广东甲基化修饰

植物m6A表观转录组修饰的生物学功能尚不完全清楚。CPSF30-L是聚腺苷酸化因子CPSF30的主要亚型，由CPSF30-S和一个m6A结合的YTH结构域组成。CPSF30-L的生物学作用及其在选择性聚腺苷酸化中结合m6A功能的分子机制尚不清楚。在这里，作者揭示了CPSF30-L是拟南芥m6A的“reader”，其m6A结合功能是花卉的转型和脱落酸(ABA)响应所必需的。此外，CPSF30-L的m6A结合活性增强了液体样核体的形成，其中CPSF30-L主要识别m6A修饰的远上游元件，调控聚腺苷酸化位点的选择。种种研究迹象表明m6A 存在于很多物种中，占到了 RNA甲基化修饰的80%。广东甲基化修饰

RNA 修饰在基因表达调控中扮演着非常重要的角色。m6A 修饰就是真核生物 mRNA 中较常见存在的一种修饰形式，得到了常见的关注和研究。除此之外，还存在着一种分子结构上非常相似的 RNA 修饰形式：m6Am——在 m6A 修饰的基础上，同一个腺苷酸残基的核糖的 2’ 羟基也被甲基化，产生 2’ 甲氧基结构（2’-O-CH3）。与 m6A 的常见分布所不同的是，m6Am 修饰的分布主要局限于 mRNA 5’ 帽子结构下游的较早核苷酸残基上发生。该位点的 m6Am 修饰在进化上高度保守，无论是在斑马鱼、小鼠还是人类细胞中均有发现。内蒙古m7G RNA甲基化适用于m6A RNA甲基化谱研究，快速筛选m6A RNA甲基化靶基因。

PNAS| 8-oxoG在mRNA中的积累可以改变哺乳动物细胞中的蛋白质翻译 发表时间：2018年4月17号 影响因子：9.412 PNAS杂志发表了来自国家老年医学中心、北京医院研究的一篇有关O8G氧化修饰改变哺乳动物细胞中蛋白合成的研究成果。文章题目为“Transcriptional mutagenesis mediated by 8-oxoG induces translational errors in mammalian cells”。 哺乳动物细胞内形成的活性氧可以在mRNA中产生8-oxoG修饰，这一氧化修饰在基因表达过程中会导致碱基错配。本研究首先构建了一种基于超敏荧光素酶Gluc（Gussia luciferase）的报告基因检测系统，通过第二代测序技术发现当RNA中8-oxoG含量增加使U-to-G位点增加，从而诱导表达淀粉样前体蛋白的淀粉样β肽（老年痴呆的重要标志物）。该研究结果表明，8-oxoG在mRNA中的积累可以改变哺乳动物细胞中的蛋白质合成。本论文的发表为深入氧化修饰与蛋白合成间的分子机理提供了全新的研究思路！

LncRNA m6Am-Exo-seq 测序服务 云序生物在国内shou批引入 m6Am-Exo-seq 测序服务，利用 5’ 核酸外切酶消除非目的性的 RNA 的片段上 m6A 修饰的信号干扰，选择性地获取 mRNA以及 LncRNA 的 5’ 帽子结构下游 m6Am 修饰富集区域的序列信息。接下来，我们对选择性获取到的 m6Am 修饰的 RNA 的片段进行反转录建库和高通量测序（测序结果将同时包含 mRNA 和 LncRNA）。通过后续的生物信息学分析，可以区分来自 mRNA 和 LncRNA 的测序片段，从而较全揭示 LncRNA和mRNA 的 m6Am 修饰位点，并推测其可能的生物学功能。 2’-O-RNA甲基化修饰在mRNA、tRNA、rRNA、miRNA等分子上分布。

m1A RNA甲基化是一类新发现的RNA甲基化，即RNA分子腺嘌呤第1位氮原子上的甲基化修饰（N1-methyladenosine，m1A）。研究表明，m1A是真核生物tRNA和rRNA丰度很高的一种转录后修饰，近期研究也表明m1A修饰可调控mRNA翻译。m1A修饰作为一类新型RNA甲基化，其功能和机制都亟待挖掘。 与m6A RNA检测方式一致，针对m1A修饰也采用MeRIP-seq技术，抗体富集的技术原理如下：将m1A RNA甲基化特异性抗体与被随机打断的RNA的片段进行共孵育，抓取有甲基化修饰的片段进行测序；同时需要平行测序一个对照（Input）样本，对照样本为未进行IP反应的RAN片段，对照样本用于消除非特异性抓取甲基化片段的背景。在全转录范围内及tRNA水平查看基因m5C甲基化修饰水平。天津ac4C RNA乙酰化甲基化

云序生物自2018年推出了超微量RNA甲基化测序。广东甲基化修饰

目前还没有一种完善的方法可以在单碱基分辨率下对每个转录本进行m6A的鉴定，这对评估m6A丰度是必要的。作者开发了一种新的方法，称为Nanom6A，用于在单碱基分辨率下鉴定和定量m6A修饰，使用基于XGBoost模型的纳米孔直接RNA测序。并使用MeRIP-Seq和m6A-REF-seq验证了此方法，证实了较高的准确性。利用这种方法，作者进行了毛果杨茎分化木质部中转录组范围的m6A修饰定量分析，揭示了不同的可变聚腺苷酸化(APA)量会导致不同的m6A修饰比例。广东甲基化修饰