云序优势 单碱基分辨 分辨率高,可以直接检测到发生甲基化的确切位点。 覆盖范围广: 检测>850,000个 CpG 位点,覆盖CpG岛、启动子、编码区、开放染色质和增强子等。 一站式服务: 客户只需提供细胞、组织或基因组DNA,云序生物为您完成从DNA富集,文库制备,上机测序到数据分析整套服务流程。 严格的质控: 云序生物对805K芯片测序实验的各个关键步骤进行严格的质控,全程监控实验质量,确保客户得到优zhi的数据。 专业的生物信息学分析 专业的生物信息学团队,能够满足客户的各类深入数据分析需求。环状DNA连登《Nature》《Cell》等期刊,彻底颠覆了人们对基因遗传的传统认知。贵州云序表观遗传组测序分析
云序优势 一站式服务: 客户只需提供细胞或组织,云序生物为您完成从样品准备、文库制备、上机测序到数据分析的整套服务流程。 严格的质控: 严格的质控是ChIP-Seq实验成功的前提。云序生物对ChIP-Seq实验的各个环节进行严格的质控,尽可能地降低实验风险。 优化的ChIP流程: ChIP富集效率是ChIP-Seq成败的关键,云序生物采用商业化ChIP试剂盒和优化的实验流程,确保客户获得更好的数据。 专业的生物信息学分析: 云序生物具有强大的生物信息学团队,能够满足客户的各类深入数据分析需求。中国台湾平台表观遗传组测序案例该团队基于转座酶和m5C位点酶学转化方法开发出了环状DNA甲基化测序技术。
案例2:良性和恶性外周神经鞘膜瘤的比较甲基化组分析 Feber, A., G. A. Wilson, et al. "Comparative methylome analysis of benign and malignant peripheral nerve sheath tumors." Genome Res 21(4): 515-24. MeDIP测序可以对基因组中的甲基化区进行无偏差的分析,而不只局限于基因启动子和CpG岛。本文通过MeDIP测序对恶性外周神经鞘膜瘤、良性神经纤维瘤和正常雪旺细胞中的甲基化组进行了比较分析,找到了101,466个ai症特异性差异甲基化区(cDMRs)。数据表明:这些cDMRs在两类卫星重复序列(SATR1 和ARL a)中明显富集;此外,高甲基化cDMRs在CpG岛岸、非CpG岛相关启动子中明显富集,而低甲基化cDMRs在SINE重复序列中明显富集。通过与基因表达数据的联合分析发现:与CpG岛岸cDMRs相关的基因的表达模式可以区分疾病表型。
传统观点认为真核基因组通常形成稳定的线性染色体。但新的研究表明:无论是在正常体细胞还是ai细胞中,都存在大量染色体外环状DNA。近日,Nature杂志上发表了颠覆性研究成果:在tumsor中,主要的ai基因转录本是直接来自于环状DNA的,而环状DNA的染色质是高度开放的,环状DNA的ai基因能够大量表达,同时缺乏丝粒,导致不遵照孟德尔定律进行遗传,这种特性使得环状DNA是驱动tumsor异质性的重要机制。由此可见,由于其结构和表达的特异性,环状DNA可以影响细胞生命活动,促进tumsor细胞演进和适应性进化,增加了基因组的可塑性和不稳定性。目前,环状DNA不但可以作为一种新型特异的tumsor标志物,还在tumsor发生和发展机理研究中发挥着重大的潜在价值。可以预见的是,环状DNA将迅速成为新的科研热点,甚至会对传统遗传学和基因组学带来**性影响。可以预见的是,环状DNA将迅速成为新的科研热点。
指导用药:与传统组织相比,取样简单、相对无创。采用ctDNA检测相应驱动基因突变,指导靶向医治。也可同时进行耐药突变检测,指导耐药后医治。 tumsor代表性:tumsor异质性强,传统组织样本的检测有时会因代表性欠佳而使医治失败。ctDNA能更好的反映tumsor全貌,有效避免tumsor异质性难题。 实时监控:无创易获取的特点,使ctDNA样本能随时获得,对全程医治中的各个时间点进行相应突变的实时监控,动态监测满足了个体化医治时代的需求。云序生物提供的MeDIP测序服务,将甲基化DNA免疫共沉淀技术(MeDIP)和高通量测序相结合,能够帮助客户快速地获取全基因组范围内的DNA甲基化图谱,并比较不同样品中的甲基化分布差异。ctDNA甲基化基因的有效性(AUC:0.816)远高于传统分子标志物AFP(AUC:0.969)。湖南文章 表观遗传组测序是什么
ctDNA甲基化不但可以作为tumsour分子标志物,还可用于追溯tumsour细胞的组织来源。贵州云序表观遗传组测序分析
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