企业商机
表观遗传组测序基本参数
  • 品牌
  • 高通量测序,测序合成,科研,技术服务
  • 公司名称
  • 上海云序生物科技有限公司
  • 行业类型
  • 生物
  • 安全质量检测类型
  • 测序
  • 所在地
  • 北京,海南,上海,河北,广州,河南,湖北,深圳,成都,湖南,杭州,吉林,南京,江苏,天津,江西,武汉,辽宁,重庆,宁夏,安徽,青海,中国澳门,山东,福建,山西,甘肃,陕西,广东,四川,广西,中国台湾,贵州,西藏,内蒙古,黑龙江,浙江,云南,新疆,香港
  • 检测类型
  • 测序
表观遗传组测序企业商机

不同于已经得到深入研究的基因组 DNA 的表观遗传修饰,ctDNA 的 5mC 甲基化修饰研究仍然是一个未被充分探索的领域,对于科研者来说是一个尚待挖掘的金矿。既然如此,那我们是不是可以按图索骥,直接将基因组 DNA 甲基化修饰研究的传统方法照搬到 ctDNA 的5mC 甲基化修饰研究上来呢?答案是否定的:因为 ctDNA 含量低、缺乏染色质结构的保护,若直接将研究基因组 DNA 的 5mC 修饰的传统方法应用于 ctDNA,则会遇到南橘北枳的困境,云序生物提供的MeDIP测序服务,将甲基化DNA免疫共沉淀技术(MeDIP)和高通量测序相结合,能够帮助客户快速地获取全基因组范围内的DNA甲基化图谱,并比较不同样品中的甲基化分布差异。作者还发现血浆中的胎儿 环状DNA 与母体 环状DNA 相比甲基化程度相对较低。云序表观遗传组测序内容

早在十九世纪后期,科学家就通过显微镜观察到了蛋白质与 DNA 直接的相互作用,从那以后,他们开始深入探索蛋白质结合并控制 DNA 的作用机制。为了研究 DPI,科学家发明了很多方法:凝胶阻滞、DNaseI 足迹实验、甲基化干扰、体内足迹、酵母单杂、ChIP-Seq 等。其中 ChIP-Seq 因其能真实、完整地反映结合在 DNA 序列上的靶蛋白,是目前全基因组水平研究 DPI 的标准实验技术。 ChIP-Seq 的基本过程包括甲醛交联将细胞内与 DNA 结合的蛋白固定,再裂解细胞,超声断裂 DNA,将 DNA-蛋白质复合物结合在特异性抗体上,再用可以结合抗体的 ProteinA 磁珠将抗体-蛋白-DNA 复合物抓取下来,之后将 DNA 与蛋白解离,将 DNA的片段补平,加 A,加接头,进行高通量测序。江苏服务表观遗传组测序是什么通过温和的酶转化法,将未甲基化的胞嘧啶(C)高效地转化为尿嘧啶(U)。

技术优势 一站式服务:客户只需提供样本,云序生物为您完成从ctDNA提取,文库制备,上机测序到数据分析整套服务流程。 特异性富集ctDNA的片段:云序生物具有丰富样本处理经验,采用ctDNA提取试剂盒,富集效率高。 严格质控流程:云序生物质控流程严格,层层把关,为客户提供高准确度的结果。 专业化生物信息分析:云序生物强大生物信息团队,满足客户个性化数据分析要求。 样本要求 1)样品类型:血清、血浆、体液等。其他样本类型请详询。 2)样品量: 血清,血浆:≥5 mL; 体液:请详询。 3)样品保存: 血清、血浆、体液样品,可用液氮速冻后-80℃保存,样品保存期间避免反复冻融。 4)样品运输:样品置于1.5 mL管中,封口膜封好,干冰运输。

染色质免疫共沉淀(Chromatin Immunoprecipitation,ChIP)是研究蛋白质与DNA相互作用的经典技术,被普遍应用于转录因子结合位点或组蛋白修饰位点的研究。 云序生物提供的ChIP-Seq服务,将ChIP和高通量测序技术结合,在全基因组范围内检测与特定转录因子或组蛋白结合的DNA位点。配合强大的生信分析实力,云序生物提供的不仅是海量的测序数据,而且是根据您的研究目的,有针对性地挖掘提炼出取之即可用的结果及出版级图片。云序生物提供的MeDIP测序服务,将甲基化DNA免疫共沉淀技术(MeDIP)和高通量测序相结合,能够帮助客户快速地获取全基因组范围内的DNA甲基化图谱,并比较不同样品中的甲基化分布差异。由此可见,由于其结构和表达的特异性,环状DNA可以影响细胞生命活动。

CUT&Tag技术研究蛋白质-DNA互作的优势 原文:CUT&Tag for efficient epigenomic profiling of small samples and single cells 期刊:Nature Communications 发表时间:20190429 影响因子: 11.878 在生物学研究中,DNA与蛋白质之间的互作是至关重要的,参与基因的表达、调控、复制、重组和修复以及RNA的转运、翻译和调控等多个过程,几乎涉及所有的生命活动。目前研究两者互作的方法很多,作者选择了传统的研究手段ChIP-seq,优化的CUT&RUN方法,以及新方法CUT&Tag共同研究组蛋白H3K27me3。通过比对实验结果,发现CUT&Tag有低的背景噪声以及强的信号。通过对H3K4me1修饰物进行分析,显示CUT&Tag的灵敏度高,实验可重复性好。ai症组中ctDNA甲基化水平与正常组差异明显。新疆云序表观遗传组测序

该团队基于转座酶和m5C位点酶学转化方法开发出了环状DNA甲基化测序技术。云序表观遗传组测序内容

样本要求 样品类型: 细胞、组织、体液、总gDNA或IP后DNA。其它类型样品请详询。 样品量: a)细胞 5×108 b)组织 100 mg c)IP后DNA 10ng d)gDNA 3μg 样品运输及保存: 样品运输:样品置于1.5mL Eppendorf管中,封口膜封好,干冰运输,DNA可用冰袋运输。 样品保存:细胞样品或新鲜组织块切块,液氮冻存后-80℃保存;DNA样品短期内可-20℃,避免反复冻融。云序生物提供的MeDIP测序服务,将甲基化DNA免疫共沉淀技术(MeDIP)和高通量测序相结合,能够帮助客户快速地获取全基因组范围内的DNA甲基化图谱,并比较不同样品中的甲基化分布差异。云序表观遗传组测序内容

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