云序优势 单碱基分辨 分辨率高,可以直接检测到发生甲基化的确切位点。 覆盖范围广: 检测>850,000个 CpG 位点,覆盖CpG岛、启动子、编码区、开放染色质和增强子等。 一站式服务: 客户只需提供细胞、组织或基因组DNA,云序生物为您完成从DNA富集,文库制备,上机测序到数据分析整套服务流程。 严格的质控: 云序生物对805K芯片测序实验的各个关键步骤进行严格的质控,全程监控实验质量,确保客户得到优zhi的数据。 专业的生物信息学分析 专业的生物信息学团队,能够满足客户的各类深入数据分析需求。NIPT之父卢煜明教授团队开发了一种环状DNA 甲基化分析的测序方案。中国澳门平台表观遗传组测序分析
案例2. ATAC-seq与ChIP-seq联合分析 原文:Nfib Promotes Metastasis through a Widespread Increase in Chromatin Accessibility 期刊:Cell 影响因子:31.398 该文章是通过比较原发性和肝转移性的小细胞肺ai细胞之间的差异,从而研究人小细胞肺ai促进ai症扩散转移的背景机制。首先利用ATAC-seq,发现NFI家族转录因子富集在具有差异的染色质开放位点中,预示着NFI家族转录因子在调控tumsor细胞转移中扮演着重要角色。进一步进行ChIP-seq,通过2种测序结果联合分析,发现在染色质高开放性位点区域伴随着Nfib拷贝数量增多,且Nfib在侵袭性原发性tumsor和转移性tumsor内高表达,Nfib表现出维持染色质及远端调控区域开放和促进神经基因表达的功能,说明Nfib对促进ai细胞增殖和迁移具有重要的作用。宁夏云序表观遗传组测序是什么ctDNA羟甲基化检测为日后通过血浆样本进行无创诊断奠定了良好的基础。
案例1:小肠腺ai的特异性甲基化组图谱 本文通过MeDIP测序研究了小鼠模型小肠腺ai起始过程中的甲基化变化,发现了13,000多个与小肠腺ai发生相关的差异甲基化区(DMRs)。进一步分析发现:组蛋白修饰复合物PRC2的靶基因在高甲基化DMRs中明显富集,说明组蛋白修饰与DNA甲基化密切相关。此外,在不同类型细胞中,通过重亚硫 酸盐焦磷酸测序证实:这些DMRs是腺ai细胞中全新形成的,而不是通过小肠干细胞或未分化隐窝细胞中已有甲基化模式的扩展形成的。更为有趣的是,作者发现了一些DMRs,它们在小鼠腺ai和人类结肠ai间是保守的,并因此找到了一些在结肠ai中受表观遗传修饰的基因,揭示了甲基化修饰作为临床分子标志物的潜力。
CUT&Tag 有望将蛋白与染色质 DNA 互相作用的研究变成了一种类似 PCR 反应的常规操作,对基因调控、表观遗传等领域的研究具有**性的意义 在生物学研究中,DNA 与蛋白质之间的相互作用(DNA-Protein Interaction, DPI)是至关重要的,基因的表达、调控、复制、重组和修复,RNA 的转运、翻译和调控,都离不开 DPI,几乎所有的生命活动都会涉及 DPI。 早在十九世纪后期,科学家就通过显微镜观察到了蛋白质与 DNA 直接的相互作用,从那以后,他们开始深入探索蛋白质结合并控制 DNA 的作用机制。通过转座酶打开环状DNA的环形结构,并在DNA的片段的两端加上接头。
多次实验之间的一致性更高 EM-seq 文库在不同起始量之间的相关性都很高,表明 EM-seq 检出的数据具有很好的可重复性,且甲基化检测灵敏度不会随着起始量的减少而降低;相形之下,不同的 WGBS 文库之间的相关性就不够理想。更精准地检测转录起始位点的甲基化数据 在低表达基因的转录起始位点附近,胞嘧啶一般会发生甲基化修饰,但由于 WGBS 法倾向于低估 GC 区域,因此难免遗漏一些转录起始位点附近的甲基化修饰;EM-seq 因为其出色的 GC 覆盖均一性,可以更精准地检测转录起始位点的甲基化数。目前也习惯将巨大的环状DNA(>1Mb)称为ecDNA。上海研究表观遗传组测序案例
目前也习惯将巨大的环状DNA(>1Mb)称为ecDNA, 而将相对较小的环状DNA称为eccDNA。中国澳门平台表观遗传组测序分析
技术简介 DNA甲基化能控制基因表达,因而在动植物的生长发育过程中发挥着关键的调控作用,并且与包括ai症在内的多种人类疾病密切相关,是表观遗传学研究的热点。 云序生物提供的MeDIP测序服务,将甲基化DNA免疫共沉淀技术(MeDIP)和高通量测序相结合,能够帮助客户快速地获取全基因组范围内的DNA甲基化图谱,并比较不同样品中的甲基化分布差异。配合强大的生信分析实力,我们提供的不仅是海量的测序数据,而且是根据您的研究目的,有针对性地挖掘提炼出取之即可用的结果及出版级图片。中国澳门平台表观遗传组测序分析