技术优势 一站式服务: 客户只需提供血清血浆,云序生物为您完成环状DNA富集,甲基化位点转化,文库制备,上机测序到数据分析整套服务流程。 一箭双雕的结果: 同时检测环状DNA及其甲基化状况,节约样品,性价比高。 专业的生物信息学分析: 专业的生物信息学团队,开发了高效识别分析环状DNA的算法,且能单碱基分辨甲基化修饰位点,满足客户的各类深入数据分析需求。 样本要求 样品类型: 血清血浆或其它体液样品 样品量: 血清血浆:>5 mL 样品运输及保存: EDTA抗凝,样品干冰运输。勿用肝素管取样(绿色盖子抗凝管)。NIPT之父卢煜明教授团队开发了一种环状DNA 甲基化分析的测序方案。安徽平台表观遗传组测序
乳腺ai转移确诊后,患者已经很少能够彻底痊愈。但是现在,我们可以利用含有tumsor染色体异质性的ctDNA来对乳腺ai进行检测。在H Saal教授的研究中,他们对20例早期确诊的原发性乳腺ai患者进行了监测和长期随访。通过NGS和液体数字PCR联合使用的方法,他们能够覆盖很多低信号的全基因组测序结果,并且first发现,在手术后,ctDNA监测是高度精确的,其成功监测预示了93%的复发病人以及100%的没有复发的病人。基于ctDNA的监测中,转移患者的平均生存期是11个月,而在患者的长期不进展期的时候,是没有检测到ctDNA的。因此,ctDNA能够预测不良生存期。这些发现表明,我们可以利用ctDNA来监测早期乳腺ai患者的转移情况,并帮助修改治疗方案,避免过度医治。辽宁项目表观遗传组测序研究云序生物环状DNA甲基化测序技术基于转座酶和m5C位点酶学转化方法。
cfDNA(Cell free DNA)是人体组织排放到血液、尿液或脑脊液等循环体系中的降解的DNA小片段,是一种新型的分子标记物。ctDNA(Circulating tumor DNA)特指来源于tumsor细胞的cfDNA,是液体活检主流方向。 报道表明:ctDNA羟甲基化不但可以作为tumsor分子标志物,还可用于追溯tumsor细胞的组织来源。在医疗大趋势下,ctDNA羟甲基化检测既具有极高的科研价值,又具备推进医疗临床实践的巨大潜能,为实现tumsor临床医治的全病程管理提供强有力的支持。利用ctDNA羟甲基化测序,凭一管液体就可以进行tumsor诊断、疗效评估、实时监控、个体化用药、预测复发等,是里程碑式的新型液体活检技术。
ChIP-Seq(Chromatin Immunoprecipitation Sequencing)因能真实、完整地反映靶蛋白与DNA序列的结合情况,因而成为研究DNA-蛋白相互作用的经典方法。但ChIP-Seq继承了ChIP的难点与局限性:需要大量细胞投入(106-107),甲醛交联易导致假阳性或假阴性,对染色质的完整性、免疫沉淀抗体的特异性较为敏感,整体实验步骤复杂耗时长,测序数据背景信号高等,这些难点使得低投入量、低丰度的靶蛋白、弱结合DNA-蛋白质的研究变得较为困难。且能单碱基分辨甲基化修饰位点,满足客户的各类深入数据分析需求。
游离于染色体基因组之外的DNA (extrachromosoma l DNA,ecDNA)被发现常常以环状的形式存在,这种形式的DNA被称为环状DNA (extrachromosomal circular DNA)。目前也习惯将巨大的环状DNA(>1Mb)称为ecDNA,而将相对较小的环状DNA称为eccDNA。 环状DNA连登《Nature》《Cell》等期刊,彻底颠覆了人们对基因遗传的传统认知,成为了很有潜力的科研新热点。云序生物环状DNA甲基化测序技术基于转座酶和m5C位点酶学转化方法,用核酸外切酶V消化以去除线性DNA。通过转座酶打开环状DNA的环形结构,并在DNA的片段的两端加上接头。通过Klenow酶修复转座产物的末端缺口。通过温和的酶转化法,将未甲基化的胞嘧啶(C)高效地转化为尿嘧啶(U),后续进行文库构建与高通量测序,从而获得发生甲基化修饰的环状DNA。该技术可以同时检测环状DNA和环状DNA的甲基化修饰状态,为环状DNA的深入研究及新型分子标志物的开发提供了新的技术手段。客户需提供血浆,血清或体液样本,云序生物为您完成从ctDNA提取。中国香港分析表观遗传组测序研究
作者还发现血浆中的胎儿 环状DNA 与母体 环状DNA 相比甲基化程度相对较低。安徽平台表观遗传组测序
而NGS技术能够检测基因突变。靶向深度测序和基于捕获物测序的方法可以在指定区域进行检测。重要的是,外显子血浆DNA分析开辟了一种新的机遇,即其可以描述突变组的特征,而不需要关注之前或者现在存在的突变。基于NGS的ctDNA全基因组测序,不仅可以发现染色体重组,易位等情况,其对tumsor标记物还具有敏感性和特异性。同时,在选定的情况下,基于NGS的ctDNA测序还能发现体细胞拷贝数的畸变。正是基于以上优势,NGS在ctDNA检测中,开始扮演越来越重要的角色。而基于NGS的ctDNA检测的效果,也在很多临床实验中得到了证实。安徽平台表观遗传组测序
上海云序生物科技有限公司是一家上海云序生物科技有限公司于2015年3月成立,坐落于上海漕河泾新兴技术开发区,专注于表观修饰以及转录组领域,依托于高通量测序、定量PCR、质谱技术和生物信息学等技术,集科研服务、医学检测、产品研发于一体的****。的公司,是一家集研发、设计、生产和销售为一体的专业化公司。云序生物拥有一支经验丰富、技术创新的专业研发团队,以高度的专注和执着为客户提供RNA甲基化,表观遗传学,转录组测序,外泌体。云序生物不断开拓创新,追求出色,以技术为先导,以产品为平台,以应用为重点,以服务为保证,不断为客户创造更高价值,提供更优服务。云序生物始终关注商务服务行业。满足市场需求,提高产品价值,是我们前行的力量。