cfDNA(Cell free DNA)是人体组织排放到血液、尿液或脑脊液等循环体系中的降解的DNA小片段,是一种新型的分子标记物。ctDNA(Circulating tumor DNA)特指来源于tumsor细胞的cfDNA,是液体活检主流方向。 报道表明:ctDNA羟甲基化不但可以作为tumsor分子标志物,还可用于追溯tumsor细胞的组织来源。在医疗大趋势下,ctDNA羟甲基化检测既具有极高的科研价值,又具备推进医疗临床实践的巨大潜能,为实现tumsor临床医治的全病程管理提供强有力的支持。利用ctDNA羟甲基化测序,凭一管液体就可以进行tumsor诊断、疗效评估、实时监控、个体化用药、预测复发等,是里程碑式的新型液体活检技术。云序生物率先推出ctDNA甲基化测序服务,需1ng ctDNA既可进行测序。浙江技术表观遗传组测序文章
DNA甲基化是基因组一种主要的表观遗传修饰形式,它能够调控基因表达、染色质稳定性、X染色体失活及抑制病 毒和外源基因的表达等生物过程,与人类的ai症、衰老、老年痴呆等许多疾病密切相关,是表观遗传学研究中的热点之一。 云序生物提供新一代的DNA甲基化芯片Illumina Infinium MethylationEPIC BeadChip测序服务(下文中以850K芯片代称)。850K甲基化芯片有效的利用高通量筛选技术,不但实现基因区域和CpG岛的覆盖,还包括 CpG 岛之外的甲基化位点、在人类干细胞中鉴定出了非 CpG 甲基化位点、miRNA 启动子区域、以及tumsor和正常组织中差异表达的甲基化位点等。普遍应用于ai症、tumsor和其他复杂疾病的研究,是目前适合表观基因组全关联分析研究的全基因组DNA甲基化芯片。表观遗传组测序文章目前也习惯将巨大的环状DNA(>1Mb)称为ecDNA, 而将相对较小的环状DNA称为eccDNA。
案例1:孕妇血浆中胎儿环状DNA 的特征是:呈甲基化状态以及被clear 原文:Characteristics of Fetal Extrachromosomal Circular DNA in Maternal Plasma: Methylation Status and Clearance 期刊:Clinical Chemistry 影响因子:8.322 近期,NIPT之父卢煜明教授团队开发了一种环状DNA 甲基化分析的测序方案,通过对不同产后时间点的胎儿环状DNA含量的评估,研究了胎儿环状DNA的体外clear效率。作者还发现血浆中的胎儿 环状DNA 与母体 环状DNA 相比甲基化程度相对较低。此外,和胎儿线性DNA类似,胎儿环状DNA在分娩后从母血中迅速clear。总之,该团队基于转座酶和m5C位点酶学转化方法开发出了环状DNA甲基化测序技术,并揭示了孕妇血浆中的胎儿环状DNA甲基化状况,为环状DNA的深入研究及新型分子标志物的开发提供了新的技术手段。
技术优势 一站式服务: 客户只需提供血清血浆,云序生物为您完成环状DNA富集,甲基化位点转化,文库制备,上机测序到数据分析整套服务流程。 一箭双雕的结果: 同时检测环状DNA及其甲基化状况,节约样品,性价比高。 专业的生物信息学分析: 专业的生物信息学团队,开发了高效识别分析环状DNA的算法,且能单碱基分辨甲基化修饰位点,满足客户的各类深入数据分析需求。 样本要求 样品类型: 血清血浆或其它体液样品 样品量: 血清血浆:>5 mL 样品运输及保存: EDTA抗凝,样品干冰运输。勿用肝素管取样(绿色盖子抗凝管)。客户只需提供血清血浆,云序生物为您完成环状DNA富集,甲基化位点转化。
报道表明:ctDNA羟甲基化不但可以作为tumsor分子标志物,还可用于追溯tumsor细胞的组织来源。在医疗大趋势下,ctDNA羟甲基化检测既具有极高的科研价值,又具备推进医疗临床实践的巨大潜能,为实现tumsor临床医治的全病程管理提供强有力的支持。利用ctDNA羟甲基化测序,凭一管液体就可以进行tumsor诊断、疗效评估、实时监控、个体化用药、预测复发等,是里程碑式的新型液体活检技术。 云序生物率先推出ctDNA羟甲基化测序服务,低需1ng ctDNA既可进行测序。客户需提供血浆,血清或体液样本,云序生物为您完成从ctDNA提取,文库制备,上机测序到数据分析整套服务流程。甚至会对传统遗传学和基因组学带来**性影响。青海云序生物表观遗传组测序研究
通过转座酶打开环状DNA的环形结构,并在DNA的片段的两端加上接头。浙江技术表观遗传组测序文章
本文作者利用850K芯片分别检测健康表皮、光化性角化病表皮、皮肤鳞状细胞ai表皮的DNA甲基化状态,发现AK甲基化显示出经典的tumsor甲基化的结构与cSCC的结构高度相似,通过降低DNA甲基化年龄、非CpG岛甲基化、干细胞相关的角蛋白和增强子甲基化模式进一步分析,证实了干细胞甲基化的典型特征。同时还发现这些特征只在一半的样本中检测到,而另一半则显示出与健康的表皮关系更密切。这些都表明AK 和 cSCC 存在两种亚型,并分别起源于不同的角质形成细胞分化阶段。总而言之,本文利用高通量技术手段研究鳞状细胞aiDNA甲基化在细胞分化过程中特征性分析,为其临床学的应用奠定了基础。浙江技术表观遗传组测序文章
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