企业商机
表观遗传组测序基本参数
  • 品牌
  • 高通量测序,测序合成,科研,技术服务
  • 公司名称
  • 上海云序生物科技有限公司
  • 行业类型
  • 生物
  • 安全质量检测类型
  • 测序
  • 所在地
  • 北京,海南,上海,河北,广州,河南,湖北,深圳,成都,湖南,杭州,吉林,南京,江苏,天津,江西,武汉,辽宁,重庆,宁夏,安徽,青海,中国澳门,山东,福建,山西,甘肃,陕西,广东,四川,广西,中国台湾,贵州,西藏,内蒙古,黑龙江,浙江,云南,新疆,香港
  • 检测类型
  • 测序
表观遗传组测序企业商机

EM-seq 的优势相比于传统的WGBS 拥有多种优势: DNA 测序文库质量高、所需 DNA 起始量小 相比于WGBS,EM-seq 对 DNA 的损伤小,因此可以用更少 DNA 样品、更少的 PCR 轮数扩增出高质量的测序文库。云序生物提供的 EM-seq 服务,所需的 DNA 起始量可低至10ng。 DNA 文库的插入片段更长、更完整 相比于WGBS,EM-seq 处理后的 DNA的片段更完整,长度更长,避免产生测序缺口。出色的 GC 覆盖均一性 无论 GC 程度高低,EM-seq 的覆盖度都有均匀且优良的表现;相比之下,WGBS 测序文库高估了 AT 区,却低估了 GC 区,造成“GC 覆盖度偏误”。可用于协助评估用药疗效、复发及医治后期转移动态的监测。福建研究表观遗传组测序介绍

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CUT&Tag技术研究蛋白质-DNA互作的优势 原文:CUT&Tag for efficient epigenomic profiling of small samples and single cells 期刊:Nature Communications 发表时间:20190429 影响因子: 11.878 在生物学研究中,DNA与蛋白质之间的互作是至关重要的,参与基因的表达、调控、复制、重组和修复以及RNA的转运、翻译和调控等多个过程,几乎涉及所有的生命活动。目前研究两者互作的方法很多,作者选择了传统的研究手段ChIP-seq,优化的CUT&RUN方法,以及新方法CUT&Tag共同研究组蛋白H3K27me3。通过比对实验结果,发现CUT&Tag有低的背景噪声以及强的信号。通过对H3K4me1修饰物进行分析,显示CUT&Tag的灵敏度高,实验可重复性好。上海服务表观遗传组测序介绍云序生物质控流程严格,层层把关,为客户提供高准确度的结果。

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案例2:良性和恶性外周神经鞘膜瘤的比较甲基化组分析 Feber, A., G. A. Wilson, et al. "Comparative methylome analysis of benign and malignant peripheral nerve sheath tumors." Genome Res 21(4): 515-24. MeDIP测序可以对基因组中的甲基化区进行无偏差的分析,而不只局限于基因启动子和CpG岛。本文通过MeDIP测序对恶性外周神经鞘膜瘤、良性神经纤维瘤和正常雪旺细胞中的甲基化组进行了比较分析,找到了101,466个ai症特异性差异甲基化区(cDMRs)。数据表明:这些cDMRs在两类卫星重复序列(SATR1 和ARL a)中明显富集;此外,高甲基化cDMRs在CpG岛岸、非CpG岛相关启动子中明显富集,而低甲基化cDMRs在SINE重复序列中明显富集。通过与基因表达数据的联合分析发现:与CpG岛岸cDMRs相关的基因的表达模式可以区分疾病表型。

ATAC测序的全称是Assay for Transposase Accessible Chromatin using sequencing,运用测序手段研究转座酶可接近的染色质的一种技术。该技术通过转座酶对某种特定时空下开放的核染色质区域进行切割,进而获得在该特定时空下基因组中活跃转录的调控序列。这项技术只需少量细胞便可获得实时全基因组活性调控序列信息,应用于转录因子结合分析、核小体定位、活性调控元件分布等研究,在表观遗传机制研究领域有广阔的应用前景。 云序生物对染色质开放区域进行研究的技术是利用ATAC测序技术,其原理为:利用DNA转座酶可以携带DNA去识别染色质开放区域。人为地将携带已知DNA序列标签的转座复合物(即带着测序标签的转座酶),加入到细胞核中,再利用已知序列的标签进行建库后测序,从而识别染色质的开放区域。文库制备,上机测序到数据分析整套服务流程。

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在过去十年中,对非小细胞肺ai(NSCLC)的理解发生了重要的变化。现在证实,NSCLC具有不同的分子亚型。现在医生认为,针对NSCLC的个性化医治,应该是利用这些分子亚型匹配相对应的靶向疗法。表皮生长因子(EGFR)突变和ALK易位被认为是NSCLC医治很有效的靶点。但是EGFR和ALK的突变数量是多种多样的,并且我们检测到的突变类型还在不断地增加。因此,现代科学家们利用基于NGS的ctDNA技术,从患者血液中可以获得ROS1,BRAF,KRAS,HER2-,c-MET,RET,PIK3CA,FGFR1和DDR2的突变信息,从而利用这些突变信息为患者选择合适的靶向疗法。传统观点认为真核基因组通常形成稳定的线性染色体。中国澳门服务表观遗传组测序是什么

客户只需提供血清血浆,云序生物为您完成环状DNA富集,甲基化位点转化。福建研究表观遗传组测序介绍

指导用药:与传统组织相比,取样简单、相对无创。采用ctDNA检测相应驱动基因突变,指导靶向医治。也可同时进行耐药突变检测,指导耐药后医治。 tumsor代表性:tumsor异质性强,传统组织样本的检测有时会因代表性欠佳而使医治失败。ctDNA能更好的反映tumsor全貌,有效避免tumsor异质性难题。 实时监控:无创易获取的特点,使ctDNA样本能随时获得,对全程医治中的各个时间点进行相应突变的实时监控,动态监测满足了个体化医治时代的需求。云序生物提供的MeDIP测序服务,将甲基化DNA免疫共沉淀技术(MeDIP)和高通量测序相结合,能够帮助客户快速地获取全基因组范围内的DNA甲基化图谱,并比较不同样品中的甲基化分布差异。福建研究表观遗传组测序介绍

上海云序生物科技有限公司致力于商务服务,是一家服务型的公司。公司业务分为RNA甲基化,表观遗传学,转录组测序,外泌体等,目前不断进行创新和服务改进,为客户提供良好的产品和服务。公司将不断增强企业重点竞争力,努力学习行业知识,遵守行业规范,植根于商务服务行业的发展。在社会各界的鼎力支持下,持续创新,不断铸造***服务体验,为客户成功提供坚实有力的支持。

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