四川平台测序

m6A LncRNA测序：案例2. lincRNA 1281上的m6A 甲基化影响细胞分化 原文：N6-Methyladenosine modification of lincRNA 1281 is critically required for mESC differentiation potential 期刊：Nucleic Acids Research 影响因子：11.56 同济大学康九红团队研究发现在mESC细胞中，甲基化转移酶Mettl3能够调控lincRNA 1281发生甲基化，并且与干细胞分化能力直接相关。揭示此过程主要发生在胞浆，且由let-7能够竞争性结合linc1281，从而降低其表达量，从机制上解释了m6A在不影响到表达水平的情况下如何影响生物学功能的问题。核糖体印迹测序又称Ribosome profiling，或Ribo-seq。四川平台测序

案例1：全外显子测序在ai症研究中的应用 胰腺导管腺ai(PDA)的预后非常差，因此对其病原学的研究以及靶向干预医治非常必要。本文对109个显微切割的PDA组织样品进行了全外显子测序。研究表明：环境压力以及DNA修复基因的改变与不同的突变谱有关联。许多ai基因/抑ai基因位点发生了拷贝数变化，但只有MYC基因拷贝数扩增与比较差的预后以及腺鳞ai亚型相关。此外，作者还在PDA中发现了多个新的突变基因，其中一些与预后相关。RBM10突变往往预示着较长的生存期。90%以上的样品中发生了KRAS的突变，但只有密码子Q61的等位突变与较长的生存期相关。此外，Wnt信号通路，染色质重塑信号通路，Hedgehog信号通路，DNA修复和细胞周期相关的基因也被发现有较高的突变频率。这些数据表明了不同PDA样品的基因组多样性，并且找到了一些与预后相关的基因以及医治靶点。四川甲基化测序RNA甲基化RNA抽提，RNA质控，环状RNA特异性引物设计，环状RNA逆转录，环状RNA qPCR检测。

外显子组测序利用序列富集技术特异性的检测基因组中的外显子区域（编码蛋白的DNA区域），能够直接发现与蛋白质功能变异相关的遗传突变。与全基因组重测序相比，外显子组测序只针对外显子区域，性价比极高，更适用于大样本量疾病及ai症样本分析。外显子捕获试剂盒： 云序生物采用Agilent外显子捕获试剂盒，不仅能检测全部外显子区域，还能检测与蛋白功能密切相关的UTR区域 专业化的生物信息分析： 云序生物具有强大的生物信息学团队，能够满足客户的各类深入数据分析要求

比色法检测整体甲基化水平实验原理 比色法RNA甲基化定量检测试剂盒提供了定量检测总RNA甲基化水平的试剂。采用类似ELISA抑 制竞争免疫的方法，实验样本和RNA甲基化标准品与RNA甲基化抗体共孵育；然后转移到包被有RNA甲基化多核苷酸的条孔上。在孵育之后孔可以洗脱任何未包被的试剂然后添加检测抗体生成信号，通过微孔板读取仪（例：酶标仪）来检测。因为在样本的RNA甲基化抑 制了RNA甲基化抗体与涂抹在孔上RNA甲基化的结合，样本中更高浓度导致与在孔中的RNA甲基化结合减少。因此，从孔中测得信号或OD参数与样本中RNA甲基化的数量成反比。并且样本中RNA甲基化的量可以通过预先设定的RNA甲基化标准品来实现定量检测。样品置于1.5mL管中，封口膜封好，干冰运输。

血清血浆环状DNA测序游离于染色体基因组之外的DNA (extrachromosomal DNA，ecDNA)被发现常常以环状的形式存在，这种形式的DNA被称为环状DNA (extrachromosomal circular DNA，eccDNA）。目前也习惯将巨大的环状DNA(>1Mb)称为ecDNA, 而将相对较小的环状DNA称为eccDNA。 传统观点认为真核基因组通常形成稳定的线性染色体。但新的研究表明：无论是在正常体细胞还是cancer细胞中，都存在大量染色体外环状DNA。目前，环状DNA不只可以作为一种新型特异的tumour标志物，还在tumour发生和发展机理研究中发挥着重大的潜在价值。云序生物对ac4C RNA乙酰化检测手段为acRIP-Seq技术。广东上海云序生物测序

RIP-Seq将RIP技术与高通量测序相结合，能够高通量地检测与特定蛋白结合的RNA。四川平台测序

云序优势 单碱基分辨 m7G RNA甲基化单碱基测序方式，可对m7G甲基化修饰进行单碱基定位。 抗体富集效率高 m7G MeRIP测序方式，采用预验证的商业化抗体和精心优化的实验流程，具有极高的效率和特异性。 高通量检测 可对全转录组范围内的m7G位点进行高通量地平行检测。 全分子覆盖 可较全地对环状RNA、mRNA、lncRNA、pri-miRNA、tRNA和rRNA等多类RNA分子的m7G位点进行检测。 一站式服务 客户只需提供组织或细胞，云序生物一站式完成RNA抽提，样品预处理，建库，测序，数据分析全套流程。 专业的生物信息学分析 专业的生物信息学团队，能够满足客户的各类深入数据分析需求四川平台测序

上海云序生物科技有限公司致力于商务服务，是一家服务型的公司。云序生物致力于为客户提供良好的RNA甲基化，表观遗传学，转录组测序，外泌体，一切以用户需求为中心，深受广大客户的欢迎。公司将不断增强企业重点竞争力，努力学习行业知识，遵守行业规范，植根于商务服务行业的发展。云序生物凭借创新的产品、专业的服务、众多的成功案例积累起来的声誉和口碑，让企业发展再上新高。