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案例2:METTL1通过m7G甲基化促进let-7 MicroRNA的加工 原文:METTL1 Promotes let-7 MicroRNA Processing via m7G Methylation 期刊:Molecular Cell 影响因子:14.25 剑桥大学戈登研究所和病理学系中心,借助m7G RNA甲基化测序技术,识别了A549细胞中miRNA具有m7G甲基化修饰。该研究发现Mettl1调控的pri-let7 m7G修饰通过改变pri-let7中G-四重结构,进一步调控pre-let7和let7的表达,影响肺ai细胞迁移。该研究揭示了Mettl1依赖的m7G甲基化修饰可以作为调控miRNA结构、生物发生和细胞迁移的一种新的RNA修饰。m5C环状RNA测序,云序生物为您完成m5C RNA-Seq全套实验服务。广东上海云序生物测序

案例1:全外显子测序在ai症研究中的应用 胰腺导管腺ai(PDA)的预后非常差,因此对其病原学的研究以及靶向干预医治非常必要。本文对109个显微切割的PDA组织样品进行了全外显子测序。研究表明:环境压力以及DNA修复基因的改变与不同的突变谱有关联。许多ai基因/抑ai基因位点发生了拷贝数变化,但只有MYC基因拷贝数扩增与比较差的预后以及腺鳞ai亚型相关。此外,作者还在PDA中发现了多个新的突变基因,其中一些与预后相关。RBM10突变往往预示着较长的生存期。90%以上的样品中发生了KRAS的突变,但只有密码子Q61的等位突变与较长的生存期相关。此外,Wnt信号通路,染色质重塑信号通路,Hedgehog信号通路,DNA修复和细胞周期相关的基因也被发现有较高的突变频率。这些数据表明了不同PDA样品的基因组多样性,并且找到了一些与预后相关的基因以及医治靶点。广东上海云序生物测序样品置于1.5mL管中,封口膜封好,干冰运输。

案例1:母体血浆中染色体外环状DNA的鉴定与特性分析 原文:Identification and characterization of extrachromosomal circular DNA in maternal plasm 期刊:Proc Natl Acad Sci 影响因子:11.201 作者观察到在孕妇的血浆中存在染色体外环状DNA (环状DNA),并通过限制性内切酶和Tn5转座酶处理后的改良的测序方法,在孕妇的血浆中鉴定出了环状DNA分子。他们发现血浆的环状DNA分子比线性的长,在这些环状DNA分子中,胎儿来源的环状DNA短于母体来源的环状DNA。此外,环状DNA的闭合圆形结构可能允许抗外切酶,因此这些分子比它们的线性对应物具有更高的稳定性。这些特性为环状DNA的研究和生物标志物的开发提供了机会。

2'-o-甲基化样本要求 样品类型 细胞、组织或RNA,其他样本类型请电询。 样品量 a) 细胞:1×108 b) 组织:500 mg - 5g c) RNA:100 μg - 300 μg (OD260/280:1.6-2.3; RNA无明显降解) 样品运输及保存 样品运输:样品置于1.5mL离心管中,封口膜封好,干冰运输。 样品保存:细胞样品或新鲜组织块可用TRIZOL或RNA保护剂处理,液氮冻存后-80℃保存;RNA样品可溶于乙醇或RNA-free的超纯水中,-80℃保存,避免反复冻融。目前,环状DNA不只可以作为一种新型特异的tumour标志物,还在tumour发生和发展机理研究中发挥着重大的潜在价值。RIP-Seq将RIP技术与高通量测序相结合,能够高通量地检测与特定蛋白结合的RNA。

云序生物率先推出ctDNA甲基化测序服务,低需1ng ctDNA既可进行测序。客户只需提供血浆,血清或体液样本,云序生物为您完成从ctDNA提取,文库制备,上机测序到数据分析整套服务流程。 云序生物率先推出两种ctDNA甲基化测序服务。(1)免疫共沉淀测序(MeDIP-Seq):通过5mC抗体特异性抓取基因组上发生甲基化的ctDNA的片段,并结合高通量测序技术,高性价比检测ctDNA甲基区域;(2)单碱基测序(Bis-Seq):采用经典重亚硫 酸盐处理的方式,未发生甲基化的C碱基会转换成U,发生甲基化的C碱基还是C,并结合高通量测序技术,可对ctDNA甲基化进行单碱基精确定位。环状RNA的表达具有组织和疾病特异性,与组织发育、疾病的发生和发展密切相关。中国香港测序分析

适用于任何物种:可以检测几乎任何动植物的环状RNA。广东上海云序生物测序

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